Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smim23Q9DAL0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Smim23Q9DAL0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smim23Q9DAL0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smim23Q9DAL0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smim23Q9DAL0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smim23Q9DAL0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smim23Q9DAL0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smim23Q9DAL0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smim23Q9DAL0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smim23Q9DAL0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smim23Q9DAL0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smim23Q9DAL0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smim23Q9DAL0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smim23Q9DAL0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smim23Q9DAL0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smim23Q9DAL0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smim23Q9DAL0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smim23Q9DAL0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smim23Q9DAL0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smim23Q9DAL0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smim23Q9DAL0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smim23Q9DAL0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smim23Q9DAL0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smim23Q9DAL0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smim23Q9DAL0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smim23Q9DAL0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smim23Q9DAL0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smim23Q9DAL0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smim23Q9DAL0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smim23Q9DAL0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smim23Q9DAL0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smim23Q9DAL0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smim23Q9DAL0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smim23Q9DAL0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smim23Q9DAL0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smim23Q9DAL0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smim23Q9DAL0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smim23Q9DAL0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smim23Q9DAL0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smim23Q9DAL0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smim23Q9DAL0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smim23Q9DAL0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smim23Q9DAL0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smim23Q9DAL0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smim23Q9DAL0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smim23Q9DAL0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim23Q9DAL0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim23Q9DAL0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smim23Q9DAL0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smim23Q9DAL0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smim23Q9DAL0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smim23Q9DAL0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smim23Q9DAL0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smim23Q9DAL0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smim23Q9DAL0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smim23Q9DAL0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smim23Q9DAL0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Smim23Q9DAL0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smim23Q9DAL0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smim23Q9DAL0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smim23Q9DAL0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smim23Q9DAL0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smim23Q9DAL0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smim23Q9DAL0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smim23Q9DAL0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smim23Q9DAL0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Smim23Q9DAL0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smim23Q9DAL0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smim23Q9DAL0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smim23Q9DAL0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smim23Q9DAL0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smim23Q9DAL0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smim23Q9DAL0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smim23Q9DAL0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smim23Q9DAL0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smim23Q9DAL0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Smim23Q9DAL0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smim23Q9DAL0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smim23Q9DAL0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smim23Q9DAL0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smim23Q9DAL0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smim23Q9DAL0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smim23Q9DAL0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smim23Q9DAL0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smim23Q9DAL0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smim23Q9DAL0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smim23Q9DAL0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smim23Q9DAL0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smim23Q9DAL0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smim23Q9DAL0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smim23Q9DAL0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smim23Q9DAL0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smim23Q9DAL0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smim23Q9DAL0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smim23Q9DAL0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smim23Q9DAL0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smim23Q9DAL0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smim23Q9DAL0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smim23Q9DAL0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms