Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9DAE8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9DAE8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9DAE8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9DAE8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9DAE8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9DAE8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9DAE8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9DAE8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9DAE8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9DAE8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9DAE8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9DAE8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9DAE8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9DAE8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9DAE8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9DAE8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9DAE8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9DAE8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9DAE8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9DAE8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9DAE8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9DAE8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9DAE8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9DAE8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9DAE8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9DAE8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9DAE8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9DAE8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9DAE8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9DAE8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9DAE8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9DAE8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9DAE8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9DAE8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9DAE8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9DAE8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9DAE8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9DAE8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9DAE8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9DAE8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9DAE8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9DAE8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9DAE8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9DAE8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9DAE8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9DAE8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9DAE8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9DAE8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9DAE8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9DAE8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9DAE8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9DAE8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9DAE8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9DAE8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9DAE8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9DAE8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9DAE8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q9DAE8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q9DAE8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q9DAE8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q9DAE8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q9DAE8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9DAE8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9DAE8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9DAE8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9DAE8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9DAE8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9DAE8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9DAE8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9DAE8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9DAE8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9DAE8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9DAE8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9DAE8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9DAE8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9DAE8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9DAE8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9DAE8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9DAE8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9DAE8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9DAE8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9DAE8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9DAE8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9DAE8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9DAE8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9DAE8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9DAE8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9DAE8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9DAE8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9DAE8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9DAE8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9DAE8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9DAE8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9DAE8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9DAE8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9DAE8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9DAE8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9DAE8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9DAE8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms