Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9C6

Ccdc182, Coiled-coil domain-containing protein 182, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc182Q9D9C6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc182Q9D9C6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc182Q9D9C6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc182Q9D9C6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc182Q9D9C6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc182Q9D9C6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc182Q9D9C6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc182Q9D9C6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc182Q9D9C6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc182Q9D9C6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc182Q9D9C6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc182Q9D9C6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc182Q9D9C6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc182Q9D9C6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc182Q9D9C6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc182Q9D9C6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc182Q9D9C6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc182Q9D9C6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc182Q9D9C6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc182Q9D9C6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc182Q9D9C6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc182Q9D9C6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc182Q9D9C6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc182Q9D9C6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc182Q9D9C6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc182Q9D9C6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc182Q9D9C6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc182Q9D9C6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc182Q9D9C6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc182Q9D9C6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc182Q9D9C6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc182Q9D9C6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc182Q9D9C6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc182Q9D9C6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc182Q9D9C6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc182Q9D9C6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc182Q9D9C6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc182Q9D9C6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc182Q9D9C6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc182Q9D9C6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc182Q9D9C6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc182Q9D9C6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc182Q9D9C6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc182Q9D9C6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc182Q9D9C6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc182Q9D9C6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc182Q9D9C6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc182Q9D9C6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc182Q9D9C6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc182Q9D9C6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc182Q9D9C6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc182Q9D9C6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc182Q9D9C6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc182Q9D9C6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc182Q9D9C6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc182Q9D9C6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc182Q9D9C6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc182Q9D9C6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc182Q9D9C6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc182Q9D9C6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc182Q9D9C6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc182Q9D9C6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc182Q9D9C6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc182Q9D9C6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc182Q9D9C6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc182Q9D9C6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc182Q9D9C6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc182Q9D9C6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc182Q9D9C6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc182Q9D9C6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc182Q9D9C6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc182Q9D9C6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc182Q9D9C6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc182Q9D9C6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc182Q9D9C6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc182Q9D9C6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc182Q9D9C6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc182Q9D9C6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc182Q9D9C6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc182Q9D9C6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc182Q9D9C6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc182Q9D9C6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc182Q9D9C6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc182Q9D9C6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc182Q9D9C6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc182Q9D9C6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc182Q9D9C6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc182Q9D9C6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc182Q9D9C6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc182Q9D9C6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc182Q9D9C6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc182Q9D9C6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc182Q9D9C6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc182Q9D9C6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc182Q9D9C6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc182Q9D9C6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc182Q9D9C6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc182Q9D9C6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc182Q9D9C6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc182Q9D9C6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms