Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V0

Hm13, Minor histocompatibility antigen H13, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hm13Q9D8V0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hm13Q9D8V0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hm13Q9D8V0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hm13Q9D8V0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hm13Q9D8V0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hm13Q9D8V0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hm13Q9D8V0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hm13Q9D8V0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hm13Q9D8V0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hm13Q9D8V0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hm13Q9D8V0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hm13Q9D8V0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hm13Q9D8V0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hm13Q9D8V0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hm13Q9D8V0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hm13Q9D8V0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hm13Q9D8V0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hm13Q9D8V0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hm13Q9D8V0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hm13Q9D8V0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hm13Q9D8V0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hm13Q9D8V0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hm13Q9D8V0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hm13Q9D8V0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hm13Q9D8V0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hm13Q9D8V0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hm13Q9D8V0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hm13Q9D8V0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hm13Q9D8V0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hm13Q9D8V0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hm13Q9D8V0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hm13Q9D8V0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hm13Q9D8V0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hm13Q9D8V0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hm13Q9D8V0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hm13Q9D8V0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hm13Q9D8V0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hm13Q9D8V0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hm13Q9D8V0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hm13Q9D8V0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hm13Q9D8V0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hm13Q9D8V0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hm13Q9D8V0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hm13Q9D8V0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hm13Q9D8V0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hm13Q9D8V0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hm13Q9D8V0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hm13Q9D8V0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hm13Q9D8V0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hm13Q9D8V0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Hm13Q9D8V0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hm13Q9D8V0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hm13Q9D8V0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hm13Q9D8V0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hm13Q9D8V0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hm13Q9D8V0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hm13Q9D8V0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hm13Q9D8V0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hm13Q9D8V0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hm13Q9D8V0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hm13Q9D8V0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Hm13Q9D8V0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hm13Q9D8V0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hm13Q9D8V0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hm13Q9D8V0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hm13Q9D8V0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hm13Q9D8V0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hm13Q9D8V0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hm13Q9D8V0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hm13Q9D8V0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hm13Q9D8V0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hm13Q9D8V0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hm13Q9D8V0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hm13Q9D8V0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hm13Q9D8V0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hm13Q9D8V0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hm13Q9D8V0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hm13Q9D8V0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hm13Q9D8V0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hm13Q9D8V0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hm13Q9D8V0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hm13Q9D8V0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hm13Q9D8V0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hm13Q9D8V0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hm13Q9D8V0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hm13Q9D8V0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hm13Q9D8V0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hm13Q9D8V0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hm13Q9D8V0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hm13Q9D8V0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hm13Q9D8V0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hm13Q9D8V0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hm13Q9D8V0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hm13Q9D8V0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hm13Q9D8V0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hm13Q9D8V0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Hm13Q9D8V0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Hm13Q9D8V0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hm13Q9D8V0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hm13Q9D8V0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms