Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SlirpQ9D8T7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SlirpQ9D8T7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SlirpQ9D8T7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SlirpQ9D8T7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SlirpQ9D8T7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SlirpQ9D8T7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SlirpQ9D8T7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SlirpQ9D8T7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SlirpQ9D8T7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SlirpQ9D8T7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SlirpQ9D8T7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SlirpQ9D8T7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SlirpQ9D8T7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SlirpQ9D8T7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SlirpQ9D8T7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SlirpQ9D8T7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SlirpQ9D8T7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SlirpQ9D8T7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SlirpQ9D8T7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SlirpQ9D8T7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SlirpQ9D8T7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SlirpQ9D8T7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SlirpQ9D8T7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SlirpQ9D8T7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SlirpQ9D8T7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SlirpQ9D8T7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SlirpQ9D8T7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SlirpQ9D8T7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SlirpQ9D8T7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SlirpQ9D8T7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SlirpQ9D8T7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SlirpQ9D8T7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SlirpQ9D8T7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SlirpQ9D8T7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SlirpQ9D8T7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SlirpQ9D8T7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SlirpQ9D8T7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SlirpQ9D8T7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SlirpQ9D8T7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SlirpQ9D8T7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SlirpQ9D8T7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SlirpQ9D8T7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SlirpQ9D8T7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SlirpQ9D8T7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SlirpQ9D8T7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SlirpQ9D8T7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SlirpQ9D8T7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SlirpQ9D8T7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SlirpQ9D8T7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SlirpQ9D8T7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SlirpQ9D8T7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SlirpQ9D8T7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SlirpQ9D8T7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SlirpQ9D8T7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SlirpQ9D8T7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SlirpQ9D8T7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SlirpQ9D8T7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SlirpQ9D8T7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SlirpQ9D8T7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SlirpQ9D8T7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SlirpQ9D8T7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SlirpQ9D8T7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SlirpQ9D8T7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SlirpQ9D8T7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SlirpQ9D8T7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SlirpQ9D8T7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SlirpQ9D8T7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SlirpQ9D8T7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SlirpQ9D8T7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SlirpQ9D8T7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SlirpQ9D8T7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SlirpQ9D8T7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SlirpQ9D8T7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SlirpQ9D8T7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SlirpQ9D8T7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SlirpQ9D8T7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SlirpQ9D8T7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SlirpQ9D8T7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SlirpQ9D8T7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SlirpQ9D8T7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SlirpQ9D8T7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SlirpQ9D8T7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SlirpQ9D8T7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SlirpQ9D8T7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SlirpQ9D8T7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SlirpQ9D8T7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SlirpQ9D8T7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SlirpQ9D8T7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SlirpQ9D8T7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SlirpQ9D8T7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SlirpQ9D8T7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SlirpQ9D8T7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SlirpQ9D8T7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SlirpQ9D8T7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SlirpQ9D8T7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SlirpQ9D8T7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SlirpQ9D8T7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SlirpQ9D8T7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SlirpQ9D8T7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms