Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Derl3Q9D8K3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Derl3Q9D8K3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Derl3Q9D8K3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Derl3Q9D8K3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Derl3Q9D8K3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Derl3Q9D8K3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Derl3Q9D8K3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Derl3Q9D8K3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Derl3Q9D8K3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Derl3Q9D8K3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Derl3Q9D8K3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Derl3Q9D8K3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Derl3Q9D8K3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Derl3Q9D8K3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Derl3Q9D8K3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Derl3Q9D8K3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Derl3Q9D8K3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Derl3Q9D8K3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Derl3Q9D8K3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Derl3Q9D8K3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Derl3Q9D8K3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Derl3Q9D8K3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Derl3Q9D8K3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Derl3Q9D8K3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Derl3Q9D8K3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Derl3Q9D8K3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Derl3Q9D8K3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Derl3Q9D8K3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Derl3Q9D8K3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Derl3Q9D8K3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Derl3Q9D8K3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Derl3Q9D8K3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Derl3Q9D8K3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Derl3Q9D8K3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Derl3Q9D8K3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Derl3Q9D8K3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Derl3Q9D8K3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Derl3Q9D8K3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Derl3Q9D8K3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Derl3Q9D8K3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Derl3Q9D8K3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Derl3Q9D8K3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Derl3Q9D8K3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Derl3Q9D8K3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Derl3Q9D8K3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Derl3Q9D8K3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Derl3Q9D8K3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Derl3Q9D8K3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Derl3Q9D8K3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Derl3Q9D8K3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Derl3Q9D8K3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Derl3Q9D8K3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Derl3Q9D8K3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Derl3Q9D8K3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Derl3Q9D8K3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Derl3Q9D8K3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Derl3Q9D8K3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Derl3Q9D8K3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Derl3Q9D8K3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Derl3Q9D8K3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Derl3Q9D8K3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Derl3Q9D8K3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Derl3Q9D8K3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Derl3Q9D8K3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Derl3Q9D8K3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Derl3Q9D8K3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Derl3Q9D8K3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Derl3Q9D8K3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Derl3Q9D8K3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Derl3Q9D8K3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Derl3Q9D8K3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Derl3Q9D8K3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Derl3Q9D8K3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Derl3Q9D8K3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Derl3Q9D8K3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Derl3Q9D8K3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Derl3Q9D8K3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Derl3Q9D8K3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Derl3Q9D8K3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Derl3Q9D8K3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Derl3Q9D8K3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Derl3Q9D8K3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Derl3Q9D8K3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Derl3Q9D8K3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Derl3Q9D8K3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Derl3Q9D8K3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Derl3Q9D8K3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Derl3Q9D8K3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Derl3Q9D8K3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Derl3Q9D8K3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Derl3Q9D8K3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Derl3Q9D8K3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Derl3Q9D8K3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Derl3Q9D8K3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Derl3Q9D8K3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Derl3Q9D8K3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Derl3Q9D8K3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Derl3Q9D8K3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Derl3Q9D8K3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms