Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C6

Med11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med11Q9D8C6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Med11Q9D8C6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Med11Q9D8C6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Med11Q9D8C6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Med11Q9D8C6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Med11Q9D8C6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Med11Q9D8C6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Med11Q9D8C6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Med11Q9D8C6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Med11Q9D8C6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Med11Q9D8C6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Med11Q9D8C6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Med11Q9D8C6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Med11Q9D8C6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Med11Q9D8C6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Med11Q9D8C6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Med11Q9D8C6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Med11Q9D8C6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Med11Q9D8C6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Med11Q9D8C6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Med11Q9D8C6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Med11Q9D8C6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Med11Q9D8C6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Med11Q9D8C6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Med11Q9D8C6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Med11Q9D8C6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Med11Q9D8C6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Med11Q9D8C6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Med11Q9D8C6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Med11Q9D8C6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Med11Q9D8C6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Med11Q9D8C6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Med11Q9D8C6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Med11Q9D8C6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Med11Q9D8C6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Med11Q9D8C6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Med11Q9D8C6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Med11Q9D8C6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Med11Q9D8C6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Med11Q9D8C6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Med11Q9D8C6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Med11Q9D8C6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Med11Q9D8C6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Med11Q9D8C6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Med11Q9D8C6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Med11Q9D8C6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Med11Q9D8C6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Med11Q9D8C6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Med11Q9D8C6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Med11Q9D8C6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Med11Q9D8C6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Med11Q9D8C6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Med11Q9D8C6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Med11Q9D8C6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Med11Q9D8C6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Med11Q9D8C6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Med11Q9D8C6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Med11Q9D8C6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Med11Q9D8C6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Med11Q9D8C6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Med11Q9D8C6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Med11Q9D8C6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Med11Q9D8C6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Med11Q9D8C6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Med11Q9D8C6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Med11Q9D8C6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Med11Q9D8C6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Med11Q9D8C6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Med11Q9D8C6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Med11Q9D8C6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Med11Q9D8C6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Med11Q9D8C6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Med11Q9D8C6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Med11Q9D8C6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Med11Q9D8C6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Med11Q9D8C6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Med11Q9D8C6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Med11Q9D8C6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Med11Q9D8C6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Med11Q9D8C6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Med11Q9D8C6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Med11Q9D8C6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Med11Q9D8C6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Med11Q9D8C6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Med11Q9D8C6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Med11Q9D8C6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Med11Q9D8C6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Med11Q9D8C6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Med11Q9D8C6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Med11Q9D8C6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Med11Q9D8C6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Med11Q9D8C6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Med11Q9D8C6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Med11Q9D8C6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Med11Q9D8C6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Med11Q9D8C6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Med11Q9D8C6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Med11Q9D8C6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Med11Q9D8C6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Med11Q9D8C6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms