Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Jam3Q9D8B7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Jam3Q9D8B7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Jam3Q9D8B7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Jam3Q9D8B7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Jam3Q9D8B7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Jam3Q9D8B7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Jam3Q9D8B7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Jam3Q9D8B7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Jam3Q9D8B7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Jam3Q9D8B7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Jam3Q9D8B7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Jam3Q9D8B7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Jam3Q9D8B7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Jam3Q9D8B7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Jam3Q9D8B7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Jam3Q9D8B7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Jam3Q9D8B7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Jam3Q9D8B7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Jam3Q9D8B7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Jam3Q9D8B7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Jam3Q9D8B7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Jam3Q9D8B7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Jam3Q9D8B7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Jam3Q9D8B7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Jam3Q9D8B7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Jam3Q9D8B7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Jam3Q9D8B7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Jam3Q9D8B7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Jam3Q9D8B7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Jam3Q9D8B7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Jam3Q9D8B7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Jam3Q9D8B7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Jam3Q9D8B7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Jam3Q9D8B7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Jam3Q9D8B7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Jam3Q9D8B7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Jam3Q9D8B7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Jam3Q9D8B7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Jam3Q9D8B7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Jam3Q9D8B7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Jam3Q9D8B7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Jam3Q9D8B7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Jam3Q9D8B7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Jam3Q9D8B7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Jam3Q9D8B7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Jam3Q9D8B7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Jam3Q9D8B7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Jam3Q9D8B7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Jam3Q9D8B7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Jam3Q9D8B7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Jam3Q9D8B7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Jam3Q9D8B7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Jam3Q9D8B7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Jam3Q9D8B7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Jam3Q9D8B7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Jam3Q9D8B7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Jam3Q9D8B7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Jam3Q9D8B7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Jam3Q9D8B7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Jam3Q9D8B7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Jam3Q9D8B7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Jam3Q9D8B7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Jam3Q9D8B7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Jam3Q9D8B7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Jam3Q9D8B7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Jam3Q9D8B7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Jam3Q9D8B7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Jam3Q9D8B7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Jam3Q9D8B7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Jam3Q9D8B7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Jam3Q9D8B7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Jam3Q9D8B7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Jam3Q9D8B7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Jam3Q9D8B7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Jam3Q9D8B7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Jam3Q9D8B7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Jam3Q9D8B7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Jam3Q9D8B7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Jam3Q9D8B7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Jam3Q9D8B7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Jam3Q9D8B7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Jam3Q9D8B7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Jam3Q9D8B7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jam3Q9D8B7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jam3Q9D8B7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jam3Q9D8B7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jam3Q9D8B7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Jam3Q9D8B7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Jam3Q9D8B7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Jam3Q9D8B7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Jam3Q9D8B7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Jam3Q9D8B7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Jam3Q9D8B7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Jam3Q9D8B7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Jam3Q9D8B7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Jam3Q9D8B7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Jam3Q9D8B7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Jam3Q9D8B7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Jam3Q9D8B7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms