Protein–RNA interactions for Protein: Q9D880

Timm50, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm50Q9D880 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Timm50Q9D880 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Timm50Q9D880 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Timm50Q9D880 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Timm50Q9D880 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Timm50Q9D880 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Timm50Q9D880 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Timm50Q9D880 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Timm50Q9D880 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Timm50Q9D880 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Timm50Q9D880 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Timm50Q9D880 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Timm50Q9D880 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Timm50Q9D880 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Timm50Q9D880 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Timm50Q9D880 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Timm50Q9D880 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Timm50Q9D880 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Timm50Q9D880 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Timm50Q9D880 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Timm50Q9D880 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Timm50Q9D880 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Timm50Q9D880 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Timm50Q9D880 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Timm50Q9D880 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Timm50Q9D880 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Timm50Q9D880 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Timm50Q9D880 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Timm50Q9D880 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Timm50Q9D880 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Timm50Q9D880 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Timm50Q9D880 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Timm50Q9D880 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Timm50Q9D880 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Timm50Q9D880 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Timm50Q9D880 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Timm50Q9D880 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Timm50Q9D880 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Timm50Q9D880 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Timm50Q9D880 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Timm50Q9D880 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Timm50Q9D880 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Timm50Q9D880 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Timm50Q9D880 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Timm50Q9D880 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Timm50Q9D880 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Timm50Q9D880 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Timm50Q9D880 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Timm50Q9D880 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Timm50Q9D880 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Timm50Q9D880 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Timm50Q9D880 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Timm50Q9D880 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Timm50Q9D880 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Timm50Q9D880 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Timm50Q9D880 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Timm50Q9D880 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Timm50Q9D880 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Timm50Q9D880 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Timm50Q9D880 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Timm50Q9D880 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Timm50Q9D880 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Timm50Q9D880 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Timm50Q9D880 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Timm50Q9D880 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Timm50Q9D880 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Timm50Q9D880 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Timm50Q9D880 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Timm50Q9D880 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Timm50Q9D880 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Timm50Q9D880 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Timm50Q9D880 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Timm50Q9D880 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Timm50Q9D880 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Timm50Q9D880 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Timm50Q9D880 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Timm50Q9D880 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Timm50Q9D880 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Timm50Q9D880 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Timm50Q9D880 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Timm50Q9D880 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Timm50Q9D880 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Timm50Q9D880 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Timm50Q9D880 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Timm50Q9D880 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Timm50Q9D880 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Timm50Q9D880 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Timm50Q9D880 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Timm50Q9D880 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Timm50Q9D880 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timm50Q9D880 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timm50Q9D880 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Timm50Q9D880 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Timm50Q9D880 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Timm50Q9D880 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Timm50Q9D880 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Timm50Q9D880 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Timm50Q9D880 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Timm50Q9D880 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Timm50Q9D880 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms