Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cyp2c55Q9D816 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cyp2c55Q9D816 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cyp2c55Q9D816 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cyp2c55Q9D816 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cyp2c55Q9D816 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cyp2c55Q9D816 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cyp2c55Q9D816 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cyp2c55Q9D816 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cyp2c55Q9D816 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cyp2c55Q9D816 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cyp2c55Q9D816 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cyp2c55Q9D816 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cyp2c55Q9D816 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cyp2c55Q9D816 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cyp2c55Q9D816 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cyp2c55Q9D816 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyp2c55Q9D816 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyp2c55Q9D816 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyp2c55Q9D816 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cyp2c55Q9D816 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cyp2c55Q9D816 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cyp2c55Q9D816 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cyp2c55Q9D816 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cyp2c55Q9D816 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cyp2c55Q9D816 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cyp2c55Q9D816 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cyp2c55Q9D816 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyp2c55Q9D816 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyp2c55Q9D816 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyp2c55Q9D816 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyp2c55Q9D816 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyp2c55Q9D816 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp2c55Q9D816 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyp2c55Q9D816 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyp2c55Q9D816 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyp2c55Q9D816 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyp2c55Q9D816 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyp2c55Q9D816 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyp2c55Q9D816 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyp2c55Q9D816 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cyp2c55Q9D816 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cyp2c55Q9D816 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyp2c55Q9D816 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyp2c55Q9D816 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp2c55Q9D816 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp2c55Q9D816 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp2c55Q9D816 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp2c55Q9D816 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp2c55Q9D816 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp2c55Q9D816 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp2c55Q9D816 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cyp2c55Q9D816 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp2c55Q9D816 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp2c55Q9D816 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp2c55Q9D816 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp2c55Q9D816 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp2c55Q9D816 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp2c55Q9D816 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp2c55Q9D816 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp2c55Q9D816 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp2c55Q9D816 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp2c55Q9D816 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cyp2c55Q9D816 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cyp2c55Q9D816 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp2c55Q9D816 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp2c55Q9D816 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp2c55Q9D816 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp2c55Q9D816 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp2c55Q9D816 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp2c55Q9D816 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp2c55Q9D816 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp2c55Q9D816 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp2c55Q9D816 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp2c55Q9D816 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp2c55Q9D816 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp2c55Q9D816 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyp2c55Q9D816 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyp2c55Q9D816 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyp2c55Q9D816 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyp2c55Q9D816 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyp2c55Q9D816 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyp2c55Q9D816 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyp2c55Q9D816 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyp2c55Q9D816 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cyp2c55Q9D816 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyp2c55Q9D816 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp2c55Q9D816 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp2c55Q9D816 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp2c55Q9D816 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp2c55Q9D816 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp2c55Q9D816 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp2c55Q9D816 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp2c55Q9D816 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp2c55Q9D816 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp2c55Q9D816 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp2c55Q9D816 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyp2c55Q9D816 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cyp2c55Q9D816 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cyp2c55Q9D816 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms