Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn23Q9D7D7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn23Q9D7D7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn23Q9D7D7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn23Q9D7D7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn23Q9D7D7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn23Q9D7D7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn23Q9D7D7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn23Q9D7D7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn23Q9D7D7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Cldn23Q9D7D7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Cldn23Q9D7D7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn23Q9D7D7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn23Q9D7D7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cldn23Q9D7D7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn23Q9D7D7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn23Q9D7D7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn23Q9D7D7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn23Q9D7D7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn23Q9D7D7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn23Q9D7D7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn23Q9D7D7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn23Q9D7D7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn23Q9D7D7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn23Q9D7D7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn23Q9D7D7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn23Q9D7D7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn23Q9D7D7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cldn23Q9D7D7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn23Q9D7D7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn23Q9D7D7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn23Q9D7D7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn23Q9D7D7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn23Q9D7D7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn23Q9D7D7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn23Q9D7D7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn23Q9D7D7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn23Q9D7D7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn23Q9D7D7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn23Q9D7D7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn23Q9D7D7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Cldn23Q9D7D7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cldn23Q9D7D7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cldn23Q9D7D7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn23Q9D7D7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn23Q9D7D7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn23Q9D7D7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Cldn23Q9D7D7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cldn23Q9D7D7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cldn23Q9D7D7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cldn23Q9D7D7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cldn23Q9D7D7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn23Q9D7D7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn23Q9D7D7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn23Q9D7D7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn23Q9D7D7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn23Q9D7D7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn23Q9D7D7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn23Q9D7D7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn23Q9D7D7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn23Q9D7D7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn23Q9D7D7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn23Q9D7D7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn23Q9D7D7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn23Q9D7D7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn23Q9D7D7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn23Q9D7D7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn23Q9D7D7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn23Q9D7D7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn23Q9D7D7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn23Q9D7D7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn23Q9D7D7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cldn23Q9D7D7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn23Q9D7D7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn23Q9D7D7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn23Q9D7D7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn23Q9D7D7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn23Q9D7D7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn23Q9D7D7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn23Q9D7D7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn23Q9D7D7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn23Q9D7D7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn23Q9D7D7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn23Q9D7D7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn23Q9D7D7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn23Q9D7D7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn23Q9D7D7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cldn23Q9D7D7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn23Q9D7D7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn23Q9D7D7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn23Q9D7D7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn23Q9D7D7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn23Q9D7D7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn23Q9D7D7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn23Q9D7D7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn23Q9D7D7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn23Q9D7D7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn23Q9D7D7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn23Q9D7D7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn23Q9D7D7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms