Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5L7

Spsb1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb1Q9D5L7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spsb1Q9D5L7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spsb1Q9D5L7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spsb1Q9D5L7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spsb1Q9D5L7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spsb1Q9D5L7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spsb1Q9D5L7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spsb1Q9D5L7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spsb1Q9D5L7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spsb1Q9D5L7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spsb1Q9D5L7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spsb1Q9D5L7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Spsb1Q9D5L7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Spsb1Q9D5L7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spsb1Q9D5L7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Spsb1Q9D5L7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spsb1Q9D5L7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spsb1Q9D5L7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spsb1Q9D5L7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spsb1Q9D5L7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spsb1Q9D5L7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spsb1Q9D5L7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spsb1Q9D5L7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spsb1Q9D5L7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spsb1Q9D5L7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spsb1Q9D5L7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spsb1Q9D5L7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spsb1Q9D5L7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spsb1Q9D5L7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spsb1Q9D5L7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spsb1Q9D5L7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spsb1Q9D5L7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spsb1Q9D5L7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spsb1Q9D5L7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spsb1Q9D5L7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Spsb1Q9D5L7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spsb1Q9D5L7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spsb1Q9D5L7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spsb1Q9D5L7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spsb1Q9D5L7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spsb1Q9D5L7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Spsb1Q9D5L7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Spsb1Q9D5L7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spsb1Q9D5L7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Spsb1Q9D5L7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spsb1Q9D5L7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spsb1Q9D5L7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spsb1Q9D5L7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spsb1Q9D5L7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spsb1Q9D5L7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Spsb1Q9D5L7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Spsb1Q9D5L7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Spsb1Q9D5L7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spsb1Q9D5L7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spsb1Q9D5L7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spsb1Q9D5L7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spsb1Q9D5L7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spsb1Q9D5L7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spsb1Q9D5L7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spsb1Q9D5L7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spsb1Q9D5L7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spsb1Q9D5L7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spsb1Q9D5L7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spsb1Q9D5L7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spsb1Q9D5L7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spsb1Q9D5L7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spsb1Q9D5L7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spsb1Q9D5L7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spsb1Q9D5L7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spsb1Q9D5L7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spsb1Q9D5L7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spsb1Q9D5L7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spsb1Q9D5L7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spsb1Q9D5L7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spsb1Q9D5L7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spsb1Q9D5L7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spsb1Q9D5L7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spsb1Q9D5L7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spsb1Q9D5L7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spsb1Q9D5L7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spsb1Q9D5L7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spsb1Q9D5L7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spsb1Q9D5L7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spsb1Q9D5L7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spsb1Q9D5L7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spsb1Q9D5L7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spsb1Q9D5L7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spsb1Q9D5L7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spsb1Q9D5L7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spsb1Q9D5L7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Spsb1Q9D5L7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Spsb1Q9D5L7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Spsb1Q9D5L7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spsb1Q9D5L7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spsb1Q9D5L7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Spsb1Q9D5L7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spsb1Q9D5L7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spsb1Q9D5L7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spsb1Q9D5L7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Spsb1Q9D5L7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms