Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc7Q9D541 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc7Q9D541 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc7Q9D541 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc7Q9D541 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc7Q9D541 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc7Q9D541 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc7Q9D541 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc7Q9D541 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc7Q9D541 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc7Q9D541 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc7Q9D541 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc7Q9D541 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc7Q9D541 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc7Q9D541 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc7Q9D541 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc7Q9D541 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc7Q9D541 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc7Q9D541 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc7Q9D541 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc7Q9D541 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc7Q9D541 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc7Q9D541 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc7Q9D541 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc7Q9D541 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc7Q9D541 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc7Q9D541 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc7Q9D541 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc7Q9D541 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc7Q9D541 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc7Q9D541 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc7Q9D541 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc7Q9D541 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc7Q9D541 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc7Q9D541 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc7Q9D541 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc7Q9D541 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc7Q9D541 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc7Q9D541 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc7Q9D541 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc7Q9D541 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc7Q9D541 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc7Q9D541 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc7Q9D541 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc7Q9D541 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc7Q9D541 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc7Q9D541 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc7Q9D541 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc7Q9D541 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc7Q9D541 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc7Q9D541 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc7Q9D541 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc7Q9D541 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc7Q9D541 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc7Q9D541 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc7Q9D541 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc7Q9D541 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc7Q9D541 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc7Q9D541 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc7Q9D541 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc7Q9D541 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccdc7Q9D541 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc7Q9D541 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc7Q9D541 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc7Q9D541 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc7Q9D541 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc7Q9D541 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc7Q9D541 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc7Q9D541 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc7Q9D541 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc7Q9D541 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc7Q9D541 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc7Q9D541 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc7Q9D541 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc7Q9D541 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc7Q9D541 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc7Q9D541 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc7Q9D541 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc7Q9D541 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc7Q9D541 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc7Q9D541 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc7Q9D541 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ccdc7Q9D541 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc7Q9D541 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc7Q9D541 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc7Q9D541 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc7Q9D541 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc7Q9D541 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc7Q9D541 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc7Q9D541 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc7Q9D541 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc7Q9D541 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc7Q9D541 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc7Q9D541 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc7Q9D541 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc7Q9D541 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc7Q9D541 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc7Q9D541 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc7Q9D541 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc7Q9D541 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms