Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cfap53Q9D439 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cfap53Q9D439 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cfap53Q9D439 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cfap53Q9D439 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Cfap53Q9D439 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cfap53Q9D439 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cfap53Q9D439 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cfap53Q9D439 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cfap53Q9D439 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cfap53Q9D439 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cfap53Q9D439 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cfap53Q9D439 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Cfap53Q9D439 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cfap53Q9D439 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cfap53Q9D439 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cfap53Q9D439 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cfap53Q9D439 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cfap53Q9D439 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cfap53Q9D439 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Cfap53Q9D439 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cfap53Q9D439 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cfap53Q9D439 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cfap53Q9D439 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cfap53Q9D439 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cfap53Q9D439 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cfap53Q9D439 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cfap53Q9D439 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cfap53Q9D439 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cfap53Q9D439 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cfap53Q9D439 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cfap53Q9D439 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cfap53Q9D439 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cfap53Q9D439 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cfap53Q9D439 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Cfap53Q9D439 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cfap53Q9D439 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cfap53Q9D439 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cfap53Q9D439 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cfap53Q9D439 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cfap53Q9D439 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cfap53Q9D439 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cfap53Q9D439 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cfap53Q9D439 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cfap53Q9D439 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cfap53Q9D439 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cfap53Q9D439 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Cfap53Q9D439 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cfap53Q9D439 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cfap53Q9D439 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cfap53Q9D439 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cfap53Q9D439 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Cfap53Q9D439 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cfap53Q9D439 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cfap53Q9D439 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cfap53Q9D439 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cfap53Q9D439 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cfap53Q9D439 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cfap53Q9D439 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cfap53Q9D439 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cfap53Q9D439 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cfap53Q9D439 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cfap53Q9D439 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cfap53Q9D439 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cfap53Q9D439 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cfap53Q9D439 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cfap53Q9D439 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cfap53Q9D439 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cfap53Q9D439 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Cfap53Q9D439 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cfap53Q9D439 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cfap53Q9D439 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Cfap53Q9D439 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cfap53Q9D439 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cfap53Q9D439 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cfap53Q9D439 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cfap53Q9D439 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cfap53Q9D439 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cfap53Q9D439 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cfap53Q9D439 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cfap53Q9D439 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cfap53Q9D439 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cfap53Q9D439 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cfap53Q9D439 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cfap53Q9D439 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cfap53Q9D439 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Cfap53Q9D439 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cfap53Q9D439 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cfap53Q9D439 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cfap53Q9D439 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cfap53Q9D439 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cfap53Q9D439 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cfap53Q9D439 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cfap53Q9D439 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cfap53Q9D439 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cfap53Q9D439 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cfap53Q9D439 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Cfap53Q9D439 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cfap53Q9D439 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Cfap53Q9D439 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms