Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Rasgef1cQ9D300 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rasgef1cQ9D300 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rasgef1cQ9D300 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rasgef1cQ9D300 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rasgef1cQ9D300 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rasgef1cQ9D300 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rasgef1cQ9D300 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rasgef1cQ9D300 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rasgef1cQ9D300 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rasgef1cQ9D300 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rasgef1cQ9D300 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rasgef1cQ9D300 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rasgef1cQ9D300 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rasgef1cQ9D300 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rasgef1cQ9D300 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rasgef1cQ9D300 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rasgef1cQ9D300 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Rasgef1cQ9D300 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rasgef1cQ9D300 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rasgef1cQ9D300 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rasgef1cQ9D300 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rasgef1cQ9D300 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rasgef1cQ9D300 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rasgef1cQ9D300 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rasgef1cQ9D300 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rasgef1cQ9D300 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rasgef1cQ9D300 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rasgef1cQ9D300 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Rasgef1cQ9D300 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rasgef1cQ9D300 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rasgef1cQ9D300 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rasgef1cQ9D300 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rasgef1cQ9D300 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rasgef1cQ9D300 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rasgef1cQ9D300 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rasgef1cQ9D300 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rasgef1cQ9D300 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rasgef1cQ9D300 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rasgef1cQ9D300 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rasgef1cQ9D300 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rasgef1cQ9D300 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rasgef1cQ9D300 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rasgef1cQ9D300 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rasgef1cQ9D300 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rasgef1cQ9D300 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rasgef1cQ9D300 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rasgef1cQ9D300 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rasgef1cQ9D300 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rasgef1cQ9D300 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rasgef1cQ9D300 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rasgef1cQ9D300 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rasgef1cQ9D300 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rasgef1cQ9D300 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rasgef1cQ9D300 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rasgef1cQ9D300 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rasgef1cQ9D300 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rasgef1cQ9D300 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rasgef1cQ9D300 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rasgef1cQ9D300 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rasgef1cQ9D300 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rasgef1cQ9D300 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rasgef1cQ9D300 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rasgef1cQ9D300 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Rasgef1cQ9D300 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rasgef1cQ9D300 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rasgef1cQ9D300 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rasgef1cQ9D300 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rasgef1cQ9D300 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rasgef1cQ9D300 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rasgef1cQ9D300 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rasgef1cQ9D300 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rasgef1cQ9D300 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rasgef1cQ9D300 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rasgef1cQ9D300 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rasgef1cQ9D300 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rasgef1cQ9D300 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rasgef1cQ9D300 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rasgef1cQ9D300 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rasgef1cQ9D300 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rasgef1cQ9D300 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rasgef1cQ9D300 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rasgef1cQ9D300 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rasgef1cQ9D300 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rasgef1cQ9D300 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rasgef1cQ9D300 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rasgef1cQ9D300 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rasgef1cQ9D300 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rasgef1cQ9D300 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rasgef1cQ9D300 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rasgef1cQ9D300 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rasgef1cQ9D300 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rasgef1cQ9D300 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rasgef1cQ9D300 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rasgef1cQ9D300 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rasgef1cQ9D300 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rasgef1cQ9D300 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rasgef1cQ9D300 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rasgef1cQ9D300 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rasgef1cQ9D300 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.2 ms