Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2X6

Sval1, Colon SVA-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sval1Q9D2X6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sval1Q9D2X6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sval1Q9D2X6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sval1Q9D2X6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sval1Q9D2X6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sval1Q9D2X6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sval1Q9D2X6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sval1Q9D2X6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sval1Q9D2X6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sval1Q9D2X6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sval1Q9D2X6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sval1Q9D2X6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sval1Q9D2X6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sval1Q9D2X6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sval1Q9D2X6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sval1Q9D2X6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sval1Q9D2X6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sval1Q9D2X6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sval1Q9D2X6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sval1Q9D2X6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sval1Q9D2X6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sval1Q9D2X6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sval1Q9D2X6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sval1Q9D2X6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sval1Q9D2X6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sval1Q9D2X6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sval1Q9D2X6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sval1Q9D2X6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sval1Q9D2X6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sval1Q9D2X6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sval1Q9D2X6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sval1Q9D2X6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sval1Q9D2X6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sval1Q9D2X6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sval1Q9D2X6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sval1Q9D2X6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sval1Q9D2X6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sval1Q9D2X6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sval1Q9D2X6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sval1Q9D2X6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sval1Q9D2X6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sval1Q9D2X6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sval1Q9D2X6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sval1Q9D2X6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sval1Q9D2X6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sval1Q9D2X6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sval1Q9D2X6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sval1Q9D2X6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sval1Q9D2X6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sval1Q9D2X6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sval1Q9D2X6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sval1Q9D2X6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sval1Q9D2X6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sval1Q9D2X6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sval1Q9D2X6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sval1Q9D2X6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sval1Q9D2X6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sval1Q9D2X6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sval1Q9D2X6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sval1Q9D2X6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sval1Q9D2X6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sval1Q9D2X6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sval1Q9D2X6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sval1Q9D2X6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sval1Q9D2X6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sval1Q9D2X6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sval1Q9D2X6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sval1Q9D2X6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sval1Q9D2X6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sval1Q9D2X6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sval1Q9D2X6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sval1Q9D2X6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sval1Q9D2X6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sval1Q9D2X6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sval1Q9D2X6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sval1Q9D2X6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sval1Q9D2X6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sval1Q9D2X6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sval1Q9D2X6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sval1Q9D2X6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sval1Q9D2X6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sval1Q9D2X6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sval1Q9D2X6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sval1Q9D2X6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sval1Q9D2X6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sval1Q9D2X6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sval1Q9D2X6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sval1Q9D2X6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sval1Q9D2X6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sval1Q9D2X6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sval1Q9D2X6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sval1Q9D2X6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sval1Q9D2X6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sval1Q9D2X6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sval1Q9D2X6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sval1Q9D2X6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sval1Q9D2X6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sval1Q9D2X6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sval1Q9D2X6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sval1Q9D2X6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms