Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2N9

Vps33a, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33aQ9D2N9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps33aQ9D2N9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vps33aQ9D2N9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vps33aQ9D2N9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vps33aQ9D2N9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps33aQ9D2N9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps33aQ9D2N9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps33aQ9D2N9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vps33aQ9D2N9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vps33aQ9D2N9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vps33aQ9D2N9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vps33aQ9D2N9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vps33aQ9D2N9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vps33aQ9D2N9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vps33aQ9D2N9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vps33aQ9D2N9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vps33aQ9D2N9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vps33aQ9D2N9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vps33aQ9D2N9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vps33aQ9D2N9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vps33aQ9D2N9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vps33aQ9D2N9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vps33aQ9D2N9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vps33aQ9D2N9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vps33aQ9D2N9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vps33aQ9D2N9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vps33aQ9D2N9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Vps33aQ9D2N9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vps33aQ9D2N9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vps33aQ9D2N9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vps33aQ9D2N9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vps33aQ9D2N9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vps33aQ9D2N9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vps33aQ9D2N9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vps33aQ9D2N9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vps33aQ9D2N9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vps33aQ9D2N9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vps33aQ9D2N9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vps33aQ9D2N9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vps33aQ9D2N9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vps33aQ9D2N9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vps33aQ9D2N9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vps33aQ9D2N9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vps33aQ9D2N9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vps33aQ9D2N9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vps33aQ9D2N9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Vps33aQ9D2N9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Vps33aQ9D2N9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps33aQ9D2N9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps33aQ9D2N9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps33aQ9D2N9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps33aQ9D2N9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps33aQ9D2N9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps33aQ9D2N9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps33aQ9D2N9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps33aQ9D2N9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps33aQ9D2N9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps33aQ9D2N9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps33aQ9D2N9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vps33aQ9D2N9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vps33aQ9D2N9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vps33aQ9D2N9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps33aQ9D2N9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps33aQ9D2N9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps33aQ9D2N9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps33aQ9D2N9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps33aQ9D2N9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps33aQ9D2N9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps33aQ9D2N9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps33aQ9D2N9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps33aQ9D2N9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps33aQ9D2N9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vps33aQ9D2N9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vps33aQ9D2N9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vps33aQ9D2N9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps33aQ9D2N9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps33aQ9D2N9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vps33aQ9D2N9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps33aQ9D2N9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps33aQ9D2N9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps33aQ9D2N9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps33aQ9D2N9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps33aQ9D2N9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vps33aQ9D2N9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vps33aQ9D2N9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vps33aQ9D2N9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps33aQ9D2N9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps33aQ9D2N9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps33aQ9D2N9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps33aQ9D2N9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vps33aQ9D2N9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vps33aQ9D2N9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Vps33aQ9D2N9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vps33aQ9D2N9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vps33aQ9D2N9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vps33aQ9D2N9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps33aQ9D2N9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps33aQ9D2N9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps33aQ9D2N9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps33aQ9D2N9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms