Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snapc3Q9D2C9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snapc3Q9D2C9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snapc3Q9D2C9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snapc3Q9D2C9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snapc3Q9D2C9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snapc3Q9D2C9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snapc3Q9D2C9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snapc3Q9D2C9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snapc3Q9D2C9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snapc3Q9D2C9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snapc3Q9D2C9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snapc3Q9D2C9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snapc3Q9D2C9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snapc3Q9D2C9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snapc3Q9D2C9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snapc3Q9D2C9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snapc3Q9D2C9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snapc3Q9D2C9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snapc3Q9D2C9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snapc3Q9D2C9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snapc3Q9D2C9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snapc3Q9D2C9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snapc3Q9D2C9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snapc3Q9D2C9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snapc3Q9D2C9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snapc3Q9D2C9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snapc3Q9D2C9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snapc3Q9D2C9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snapc3Q9D2C9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snapc3Q9D2C9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snapc3Q9D2C9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snapc3Q9D2C9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snapc3Q9D2C9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snapc3Q9D2C9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snapc3Q9D2C9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snapc3Q9D2C9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snapc3Q9D2C9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Snapc3Q9D2C9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snapc3Q9D2C9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snapc3Q9D2C9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snapc3Q9D2C9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snapc3Q9D2C9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snapc3Q9D2C9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snapc3Q9D2C9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snapc3Q9D2C9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snapc3Q9D2C9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snapc3Q9D2C9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snapc3Q9D2C9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snapc3Q9D2C9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snapc3Q9D2C9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Snapc3Q9D2C9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Snapc3Q9D2C9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snapc3Q9D2C9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snapc3Q9D2C9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snapc3Q9D2C9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snapc3Q9D2C9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snapc3Q9D2C9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snapc3Q9D2C9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snapc3Q9D2C9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snapc3Q9D2C9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snapc3Q9D2C9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snapc3Q9D2C9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snapc3Q9D2C9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snapc3Q9D2C9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snapc3Q9D2C9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snapc3Q9D2C9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snapc3Q9D2C9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snapc3Q9D2C9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snapc3Q9D2C9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snapc3Q9D2C9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snapc3Q9D2C9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snapc3Q9D2C9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snapc3Q9D2C9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snapc3Q9D2C9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snapc3Q9D2C9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snapc3Q9D2C9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snapc3Q9D2C9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snapc3Q9D2C9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snapc3Q9D2C9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snapc3Q9D2C9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Snapc3Q9D2C9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snapc3Q9D2C9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snapc3Q9D2C9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snapc3Q9D2C9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snapc3Q9D2C9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snapc3Q9D2C9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snapc3Q9D2C9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snapc3Q9D2C9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snapc3Q9D2C9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snapc3Q9D2C9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snapc3Q9D2C9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snapc3Q9D2C9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snapc3Q9D2C9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snapc3Q9D2C9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snapc3Q9D2C9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snapc3Q9D2C9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snapc3Q9D2C9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snapc3Q9D2C9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snapc3Q9D2C9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 517.2 ms