Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Creb3l4Q9D2A5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Creb3l4Q9D2A5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Creb3l4Q9D2A5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Creb3l4Q9D2A5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Creb3l4Q9D2A5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Creb3l4Q9D2A5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Creb3l4Q9D2A5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Creb3l4Q9D2A5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Creb3l4Q9D2A5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Creb3l4Q9D2A5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Creb3l4Q9D2A5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Creb3l4Q9D2A5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Creb3l4Q9D2A5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Creb3l4Q9D2A5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Creb3l4Q9D2A5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Creb3l4Q9D2A5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Creb3l4Q9D2A5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Creb3l4Q9D2A5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Creb3l4Q9D2A5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Creb3l4Q9D2A5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Creb3l4Q9D2A5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Creb3l4Q9D2A5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Creb3l4Q9D2A5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Creb3l4Q9D2A5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Creb3l4Q9D2A5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Creb3l4Q9D2A5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Creb3l4Q9D2A5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Creb3l4Q9D2A5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Creb3l4Q9D2A5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Creb3l4Q9D2A5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Creb3l4Q9D2A5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Creb3l4Q9D2A5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Creb3l4Q9D2A5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Creb3l4Q9D2A5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Creb3l4Q9D2A5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Creb3l4Q9D2A5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Creb3l4Q9D2A5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Creb3l4Q9D2A5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Creb3l4Q9D2A5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Creb3l4Q9D2A5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Creb3l4Q9D2A5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Creb3l4Q9D2A5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Creb3l4Q9D2A5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Creb3l4Q9D2A5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Creb3l4Q9D2A5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Creb3l4Q9D2A5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Creb3l4Q9D2A5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Creb3l4Q9D2A5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Creb3l4Q9D2A5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Creb3l4Q9D2A5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Creb3l4Q9D2A5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Creb3l4Q9D2A5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Creb3l4Q9D2A5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Creb3l4Q9D2A5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Creb3l4Q9D2A5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Creb3l4Q9D2A5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Creb3l4Q9D2A5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Creb3l4Q9D2A5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Creb3l4Q9D2A5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Creb3l4Q9D2A5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Creb3l4Q9D2A5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Creb3l4Q9D2A5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Creb3l4Q9D2A5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Creb3l4Q9D2A5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Creb3l4Q9D2A5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Creb3l4Q9D2A5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Creb3l4Q9D2A5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Creb3l4Q9D2A5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Creb3l4Q9D2A5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Creb3l4Q9D2A5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Creb3l4Q9D2A5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Creb3l4Q9D2A5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Creb3l4Q9D2A5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Creb3l4Q9D2A5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Creb3l4Q9D2A5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Creb3l4Q9D2A5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Creb3l4Q9D2A5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Creb3l4Q9D2A5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Creb3l4Q9D2A5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Creb3l4Q9D2A5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Creb3l4Q9D2A5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Creb3l4Q9D2A5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Creb3l4Q9D2A5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Creb3l4Q9D2A5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Creb3l4Q9D2A5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Creb3l4Q9D2A5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Creb3l4Q9D2A5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Creb3l4Q9D2A5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Creb3l4Q9D2A5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Creb3l4Q9D2A5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Creb3l4Q9D2A5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Creb3l4Q9D2A5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Creb3l4Q9D2A5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Creb3l4Q9D2A5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Creb3l4Q9D2A5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Creb3l4Q9D2A5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Creb3l4Q9D2A5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Creb3l4Q9D2A5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Creb3l4Q9D2A5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms