Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc6bQ9D289 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc6bQ9D289 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc6bQ9D289 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc6bQ9D289 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc6bQ9D289 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc6bQ9D289 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trappc6bQ9D289 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc6bQ9D289 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc6bQ9D289 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc6bQ9D289 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc6bQ9D289 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc6bQ9D289 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc6bQ9D289 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc6bQ9D289 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc6bQ9D289 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc6bQ9D289 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc6bQ9D289 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc6bQ9D289 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc6bQ9D289 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc6bQ9D289 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc6bQ9D289 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc6bQ9D289 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc6bQ9D289 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trappc6bQ9D289 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc6bQ9D289 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc6bQ9D289 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc6bQ9D289 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trappc6bQ9D289 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc6bQ9D289 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc6bQ9D289 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc6bQ9D289 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc6bQ9D289 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc6bQ9D289 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc6bQ9D289 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc6bQ9D289 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc6bQ9D289 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc6bQ9D289 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc6bQ9D289 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc6bQ9D289 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc6bQ9D289 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc6bQ9D289 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc6bQ9D289 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc6bQ9D289 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc6bQ9D289 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc6bQ9D289 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc6bQ9D289 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc6bQ9D289 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc6bQ9D289 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc6bQ9D289 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc6bQ9D289 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc6bQ9D289 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc6bQ9D289 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc6bQ9D289 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc6bQ9D289 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc6bQ9D289 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc6bQ9D289 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trappc6bQ9D289 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trappc6bQ9D289 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc6bQ9D289 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trappc6bQ9D289 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc6bQ9D289 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc6bQ9D289 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trappc6bQ9D289 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc6bQ9D289 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc6bQ9D289 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc6bQ9D289 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc6bQ9D289 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trappc6bQ9D289 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trappc6bQ9D289 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc6bQ9D289 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc6bQ9D289 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc6bQ9D289 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc6bQ9D289 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc6bQ9D289 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc6bQ9D289 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc6bQ9D289 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc6bQ9D289 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc6bQ9D289 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trappc6bQ9D289 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trappc6bQ9D289 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc6bQ9D289 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc6bQ9D289 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc6bQ9D289 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc6bQ9D289 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc6bQ9D289 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc6bQ9D289 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc6bQ9D289 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc6bQ9D289 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc6bQ9D289 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc6bQ9D289 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc6bQ9D289 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc6bQ9D289 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc6bQ9D289 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc6bQ9D289 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc6bQ9D289 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc6bQ9D289 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc6bQ9D289 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc6bQ9D289 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc6bQ9D289 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms