Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1M4

Eef1e1, Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eef1e1Q9D1M4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Eef1e1Q9D1M4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eef1e1Q9D1M4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Eef1e1Q9D1M4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Eef1e1Q9D1M4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Eef1e1Q9D1M4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Eef1e1Q9D1M4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Eef1e1Q9D1M4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Eef1e1Q9D1M4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Eef1e1Q9D1M4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Eef1e1Q9D1M4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Eef1e1Q9D1M4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Eef1e1Q9D1M4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Eef1e1Q9D1M4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Eef1e1Q9D1M4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Eef1e1Q9D1M4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Eef1e1Q9D1M4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Eef1e1Q9D1M4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Eef1e1Q9D1M4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Eef1e1Q9D1M4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Eef1e1Q9D1M4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Eef1e1Q9D1M4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Eef1e1Q9D1M4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Eef1e1Q9D1M4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Eef1e1Q9D1M4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Eef1e1Q9D1M4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Eef1e1Q9D1M4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eef1e1Q9D1M4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eef1e1Q9D1M4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eef1e1Q9D1M4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eef1e1Q9D1M4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eef1e1Q9D1M4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eef1e1Q9D1M4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eef1e1Q9D1M4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eef1e1Q9D1M4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eef1e1Q9D1M4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eef1e1Q9D1M4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eef1e1Q9D1M4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eef1e1Q9D1M4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eef1e1Q9D1M4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eef1e1Q9D1M4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eef1e1Q9D1M4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eef1e1Q9D1M4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eef1e1Q9D1M4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Eef1e1Q9D1M4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Eef1e1Q9D1M4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Eef1e1Q9D1M4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Eef1e1Q9D1M4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eef1e1Q9D1M4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eef1e1Q9D1M4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eef1e1Q9D1M4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eef1e1Q9D1M4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eef1e1Q9D1M4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eef1e1Q9D1M4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eef1e1Q9D1M4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Eef1e1Q9D1M4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Eef1e1Q9D1M4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eef1e1Q9D1M4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eef1e1Q9D1M4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eef1e1Q9D1M4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eef1e1Q9D1M4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eef1e1Q9D1M4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eef1e1Q9D1M4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eef1e1Q9D1M4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eef1e1Q9D1M4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Eef1e1Q9D1M4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Eef1e1Q9D1M4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eef1e1Q9D1M4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eef1e1Q9D1M4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eef1e1Q9D1M4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eef1e1Q9D1M4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eef1e1Q9D1M4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eef1e1Q9D1M4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eef1e1Q9D1M4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eef1e1Q9D1M4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Eef1e1Q9D1M4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Eef1e1Q9D1M4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eef1e1Q9D1M4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eef1e1Q9D1M4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eef1e1Q9D1M4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eef1e1Q9D1M4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eef1e1Q9D1M4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eef1e1Q9D1M4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eef1e1Q9D1M4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eef1e1Q9D1M4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eef1e1Q9D1M4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eef1e1Q9D1M4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eef1e1Q9D1M4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eef1e1Q9D1M4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eef1e1Q9D1M4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eef1e1Q9D1M4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eef1e1Q9D1M4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eef1e1Q9D1M4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eef1e1Q9D1M4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eef1e1Q9D1M4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eef1e1Q9D1M4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eef1e1Q9D1M4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eef1e1Q9D1M4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eef1e1Q9D1M4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eef1e1Q9D1M4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms