Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ube2cQ9D1C1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube2cQ9D1C1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ube2cQ9D1C1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2cQ9D1C1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ube2cQ9D1C1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube2cQ9D1C1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ube2cQ9D1C1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2cQ9D1C1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2cQ9D1C1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2cQ9D1C1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2cQ9D1C1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2cQ9D1C1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2cQ9D1C1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ube2cQ9D1C1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2cQ9D1C1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2cQ9D1C1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2cQ9D1C1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2cQ9D1C1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2cQ9D1C1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2cQ9D1C1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2cQ9D1C1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2cQ9D1C1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2cQ9D1C1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2cQ9D1C1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2cQ9D1C1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2cQ9D1C1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2cQ9D1C1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2cQ9D1C1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2cQ9D1C1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2cQ9D1C1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2cQ9D1C1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2cQ9D1C1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ube2cQ9D1C1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2cQ9D1C1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2cQ9D1C1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2cQ9D1C1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2cQ9D1C1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2cQ9D1C1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2cQ9D1C1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2cQ9D1C1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2cQ9D1C1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2cQ9D1C1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2cQ9D1C1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2cQ9D1C1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2cQ9D1C1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2cQ9D1C1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2cQ9D1C1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2cQ9D1C1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2cQ9D1C1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2cQ9D1C1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ube2cQ9D1C1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ube2cQ9D1C1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2cQ9D1C1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2cQ9D1C1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2cQ9D1C1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2cQ9D1C1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2cQ9D1C1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2cQ9D1C1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2cQ9D1C1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2cQ9D1C1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2cQ9D1C1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2cQ9D1C1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2cQ9D1C1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2cQ9D1C1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2cQ9D1C1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2cQ9D1C1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2cQ9D1C1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2cQ9D1C1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2cQ9D1C1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2cQ9D1C1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2cQ9D1C1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2cQ9D1C1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ube2cQ9D1C1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2cQ9D1C1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2cQ9D1C1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2cQ9D1C1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2cQ9D1C1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2cQ9D1C1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2cQ9D1C1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2cQ9D1C1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2cQ9D1C1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2cQ9D1C1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2cQ9D1C1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2cQ9D1C1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2cQ9D1C1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2cQ9D1C1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2cQ9D1C1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2cQ9D1C1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2cQ9D1C1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2cQ9D1C1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2cQ9D1C1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2cQ9D1C1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2cQ9D1C1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2cQ9D1C1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2cQ9D1C1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2cQ9D1C1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ube2cQ9D1C1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ube2cQ9D1C1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2cQ9D1C1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms