Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mis18aQ9CZJ6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mis18aQ9CZJ6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mis18aQ9CZJ6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mis18aQ9CZJ6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mis18aQ9CZJ6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mis18aQ9CZJ6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Mis18aQ9CZJ6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mis18aQ9CZJ6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Mis18aQ9CZJ6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Mis18aQ9CZJ6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Mis18aQ9CZJ6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Mis18aQ9CZJ6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Mis18aQ9CZJ6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Mis18aQ9CZJ6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Mis18aQ9CZJ6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mis18aQ9CZJ6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mis18aQ9CZJ6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mis18aQ9CZJ6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mis18aQ9CZJ6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mis18aQ9CZJ6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mis18aQ9CZJ6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Mis18aQ9CZJ6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mis18aQ9CZJ6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mis18aQ9CZJ6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mis18aQ9CZJ6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Mis18aQ9CZJ6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mis18aQ9CZJ6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mis18aQ9CZJ6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Mis18aQ9CZJ6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Mis18aQ9CZJ6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mis18aQ9CZJ6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mis18aQ9CZJ6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Mis18aQ9CZJ6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mis18aQ9CZJ6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mis18aQ9CZJ6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Mis18aQ9CZJ6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Mis18aQ9CZJ6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mis18aQ9CZJ6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mis18aQ9CZJ6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mis18aQ9CZJ6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mis18aQ9CZJ6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mis18aQ9CZJ6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Mis18aQ9CZJ6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Mis18aQ9CZJ6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mis18aQ9CZJ6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mis18aQ9CZJ6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mis18aQ9CZJ6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mis18aQ9CZJ6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mis18aQ9CZJ6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mis18aQ9CZJ6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Mis18aQ9CZJ6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mis18aQ9CZJ6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mis18aQ9CZJ6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mis18aQ9CZJ6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mis18aQ9CZJ6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mis18aQ9CZJ6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mis18aQ9CZJ6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mis18aQ9CZJ6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mis18aQ9CZJ6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mis18aQ9CZJ6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mis18aQ9CZJ6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mis18aQ9CZJ6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mis18aQ9CZJ6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mis18aQ9CZJ6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mis18aQ9CZJ6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mis18aQ9CZJ6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mis18aQ9CZJ6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mis18aQ9CZJ6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mis18aQ9CZJ6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mis18aQ9CZJ6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mis18aQ9CZJ6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mis18aQ9CZJ6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mis18aQ9CZJ6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Mis18aQ9CZJ6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mis18aQ9CZJ6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mis18aQ9CZJ6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mis18aQ9CZJ6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mis18aQ9CZJ6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mis18aQ9CZJ6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mis18aQ9CZJ6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mis18aQ9CZJ6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mis18aQ9CZJ6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Mis18aQ9CZJ6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Mis18aQ9CZJ6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mis18aQ9CZJ6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Mis18aQ9CZJ6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Mis18aQ9CZJ6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Mis18aQ9CZJ6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Mis18aQ9CZJ6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mis18aQ9CZJ6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mis18aQ9CZJ6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mis18aQ9CZJ6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mis18aQ9CZJ6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mis18aQ9CZJ6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mis18aQ9CZJ6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mis18aQ9CZJ6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mis18aQ9CZJ6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mis18aQ9CZJ6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mis18aQ9CZJ6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms