Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ssu72Q9CY97 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ssu72Q9CY97 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ssu72Q9CY97 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ssu72Q9CY97 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ssu72Q9CY97 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ssu72Q9CY97 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ssu72Q9CY97 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ssu72Q9CY97 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ssu72Q9CY97 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssu72Q9CY97 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ssu72Q9CY97 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ssu72Q9CY97 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ssu72Q9CY97 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ssu72Q9CY97 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssu72Q9CY97 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssu72Q9CY97 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ssu72Q9CY97 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ssu72Q9CY97 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ssu72Q9CY97 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ssu72Q9CY97 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ssu72Q9CY97 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ssu72Q9CY97 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ssu72Q9CY97 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ssu72Q9CY97 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ssu72Q9CY97 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ssu72Q9CY97 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ssu72Q9CY97 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ssu72Q9CY97 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ssu72Q9CY97 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ssu72Q9CY97 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ssu72Q9CY97 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ssu72Q9CY97 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ssu72Q9CY97 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ssu72Q9CY97 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ssu72Q9CY97 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ssu72Q9CY97 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ssu72Q9CY97 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssu72Q9CY97 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssu72Q9CY97 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssu72Q9CY97 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssu72Q9CY97 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssu72Q9CY97 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ssu72Q9CY97 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssu72Q9CY97 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssu72Q9CY97 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssu72Q9CY97 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssu72Q9CY97 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ssu72Q9CY97 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssu72Q9CY97 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ssu72Q9CY97 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssu72Q9CY97 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssu72Q9CY97 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssu72Q9CY97 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssu72Q9CY97 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssu72Q9CY97 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssu72Q9CY97 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssu72Q9CY97 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssu72Q9CY97 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssu72Q9CY97 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ssu72Q9CY97 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssu72Q9CY97 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssu72Q9CY97 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ssu72Q9CY97 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ssu72Q9CY97 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ssu72Q9CY97 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ssu72Q9CY97 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ssu72Q9CY97 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ssu72Q9CY97 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssu72Q9CY97 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ssu72Q9CY97 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ssu72Q9CY97 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ssu72Q9CY97 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ssu72Q9CY97 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssu72Q9CY97 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssu72Q9CY97 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssu72Q9CY97 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssu72Q9CY97 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssu72Q9CY97 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssu72Q9CY97 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssu72Q9CY97 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssu72Q9CY97 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssu72Q9CY97 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssu72Q9CY97 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssu72Q9CY97 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ssu72Q9CY97 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ssu72Q9CY97 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssu72Q9CY97 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssu72Q9CY97 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssu72Q9CY97 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssu72Q9CY97 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssu72Q9CY97 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssu72Q9CY97 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssu72Q9CY97 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssu72Q9CY97 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssu72Q9CY97 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssu72Q9CY97 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssu72Q9CY97 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssu72Q9CY97 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssu72Q9CY97 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms