Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gins3Q9CY94 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gins3Q9CY94 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gins3Q9CY94 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gins3Q9CY94 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gins3Q9CY94 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gins3Q9CY94 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gins3Q9CY94 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gins3Q9CY94 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gins3Q9CY94 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gins3Q9CY94 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gins3Q9CY94 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gins3Q9CY94 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gins3Q9CY94 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gins3Q9CY94 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gins3Q9CY94 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gins3Q9CY94 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gins3Q9CY94 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gins3Q9CY94 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gins3Q9CY94 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gins3Q9CY94 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gins3Q9CY94 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gins3Q9CY94 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gins3Q9CY94 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gins3Q9CY94 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gins3Q9CY94 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gins3Q9CY94 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gins3Q9CY94 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gins3Q9CY94 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gins3Q9CY94 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gins3Q9CY94 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gins3Q9CY94 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins3Q9CY94 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins3Q9CY94 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins3Q9CY94 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins3Q9CY94 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gins3Q9CY94 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gins3Q9CY94 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gins3Q9CY94 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gins3Q9CY94 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gins3Q9CY94 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gins3Q9CY94 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gins3Q9CY94 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gins3Q9CY94 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gins3Q9CY94 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gins3Q9CY94 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gins3Q9CY94 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gins3Q9CY94 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gins3Q9CY94 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gins3Q9CY94 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gins3Q9CY94 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gins3Q9CY94 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gins3Q9CY94 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gins3Q9CY94 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gins3Q9CY94 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms