Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX34

Sugt1, Protein SGT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sugt1Q9CX34 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sugt1Q9CX34 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sugt1Q9CX34 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sugt1Q9CX34 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sugt1Q9CX34 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sugt1Q9CX34 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sugt1Q9CX34 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sugt1Q9CX34 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sugt1Q9CX34 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sugt1Q9CX34 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sugt1Q9CX34 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sugt1Q9CX34 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sugt1Q9CX34 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sugt1Q9CX34 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sugt1Q9CX34 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sugt1Q9CX34 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sugt1Q9CX34 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sugt1Q9CX34 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sugt1Q9CX34 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sugt1Q9CX34 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sugt1Q9CX34 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sugt1Q9CX34 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sugt1Q9CX34 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sugt1Q9CX34 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sugt1Q9CX34 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sugt1Q9CX34 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sugt1Q9CX34 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sugt1Q9CX34 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sugt1Q9CX34 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sugt1Q9CX34 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sugt1Q9CX34 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sugt1Q9CX34 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sugt1Q9CX34 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sugt1Q9CX34 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sugt1Q9CX34 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sugt1Q9CX34 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sugt1Q9CX34 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sugt1Q9CX34 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sugt1Q9CX34 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sugt1Q9CX34 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sugt1Q9CX34 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sugt1Q9CX34 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sugt1Q9CX34 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sugt1Q9CX34 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sugt1Q9CX34 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sugt1Q9CX34 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sugt1Q9CX34 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sugt1Q9CX34 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sugt1Q9CX34 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sugt1Q9CX34 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sugt1Q9CX34 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sugt1Q9CX34 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sugt1Q9CX34 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sugt1Q9CX34 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sugt1Q9CX34 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sugt1Q9CX34 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sugt1Q9CX34 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sugt1Q9CX34 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sugt1Q9CX34 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sugt1Q9CX34 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sugt1Q9CX34 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sugt1Q9CX34 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sugt1Q9CX34 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sugt1Q9CX34 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sugt1Q9CX34 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sugt1Q9CX34 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sugt1Q9CX34 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sugt1Q9CX34 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sugt1Q9CX34 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sugt1Q9CX34 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sugt1Q9CX34 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sugt1Q9CX34 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sugt1Q9CX34 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sugt1Q9CX34 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sugt1Q9CX34 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sugt1Q9CX34 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sugt1Q9CX34 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sugt1Q9CX34 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sugt1Q9CX34 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sugt1Q9CX34 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sugt1Q9CX34 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sugt1Q9CX34 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sugt1Q9CX34 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sugt1Q9CX34 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sugt1Q9CX34 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Sugt1Q9CX34 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sugt1Q9CX34 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sugt1Q9CX34 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sugt1Q9CX34 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Sugt1Q9CX34 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sugt1Q9CX34 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sugt1Q9CX34 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sugt1Q9CX34 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sugt1Q9CX34 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sugt1Q9CX34 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sugt1Q9CX34 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sugt1Q9CX34 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sugt1Q9CX34 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sugt1Q9CX34 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sugt1Q9CX34 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms