Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY3

Setd6, N-lysine methyltransferase SETD6, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd6Q9CWY3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setd6Q9CWY3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setd6Q9CWY3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setd6Q9CWY3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setd6Q9CWY3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setd6Q9CWY3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setd6Q9CWY3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setd6Q9CWY3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setd6Q9CWY3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setd6Q9CWY3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setd6Q9CWY3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setd6Q9CWY3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setd6Q9CWY3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Setd6Q9CWY3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Setd6Q9CWY3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Setd6Q9CWY3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Setd6Q9CWY3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Setd6Q9CWY3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Setd6Q9CWY3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Setd6Q9CWY3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Setd6Q9CWY3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Setd6Q9CWY3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Setd6Q9CWY3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Setd6Q9CWY3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Setd6Q9CWY3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setd6Q9CWY3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setd6Q9CWY3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setd6Q9CWY3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setd6Q9CWY3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Setd6Q9CWY3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Setd6Q9CWY3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Setd6Q9CWY3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Setd6Q9CWY3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Setd6Q9CWY3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Setd6Q9CWY3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Setd6Q9CWY3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setd6Q9CWY3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setd6Q9CWY3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setd6Q9CWY3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Setd6Q9CWY3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Setd6Q9CWY3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Setd6Q9CWY3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Setd6Q9CWY3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setd6Q9CWY3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setd6Q9CWY3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Setd6Q9CWY3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Setd6Q9CWY3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Setd6Q9CWY3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Setd6Q9CWY3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Setd6Q9CWY3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Setd6Q9CWY3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Setd6Q9CWY3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Setd6Q9CWY3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Setd6Q9CWY3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Setd6Q9CWY3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Setd6Q9CWY3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Setd6Q9CWY3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Setd6Q9CWY3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Setd6Q9CWY3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Setd6Q9CWY3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Setd6Q9CWY3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Setd6Q9CWY3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Setd6Q9CWY3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Setd6Q9CWY3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Setd6Q9CWY3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Setd6Q9CWY3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Setd6Q9CWY3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Setd6Q9CWY3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Setd6Q9CWY3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Setd6Q9CWY3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Setd6Q9CWY3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Setd6Q9CWY3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Setd6Q9CWY3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Setd6Q9CWY3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Setd6Q9CWY3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Setd6Q9CWY3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Setd6Q9CWY3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Setd6Q9CWY3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Setd6Q9CWY3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Setd6Q9CWY3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Setd6Q9CWY3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Setd6Q9CWY3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Setd6Q9CWY3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Setd6Q9CWY3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Setd6Q9CWY3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Setd6Q9CWY3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Setd6Q9CWY3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Setd6Q9CWY3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Setd6Q9CWY3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Setd6Q9CWY3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Setd6Q9CWY3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setd6Q9CWY3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setd6Q9CWY3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setd6Q9CWY3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Setd6Q9CWY3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Setd6Q9CWY3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Setd6Q9CWY3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Setd6Q9CWY3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Setd6Q9CWY3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Setd6Q9CWY3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.2 ms