Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx47Q9CWX9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddx47Q9CWX9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ddx47Q9CWX9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ddx47Q9CWX9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ddx47Q9CWX9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ddx47Q9CWX9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ddx47Q9CWX9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ddx47Q9CWX9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ddx47Q9CWX9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ddx47Q9CWX9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ddx47Q9CWX9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ddx47Q9CWX9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ddx47Q9CWX9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ddx47Q9CWX9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ddx47Q9CWX9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ddx47Q9CWX9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ddx47Q9CWX9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddx47Q9CWX9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddx47Q9CWX9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddx47Q9CWX9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddx47Q9CWX9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddx47Q9CWX9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ddx47Q9CWX9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ddx47Q9CWX9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ddx47Q9CWX9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddx47Q9CWX9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddx47Q9CWX9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddx47Q9CWX9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddx47Q9CWX9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddx47Q9CWX9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddx47Q9CWX9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddx47Q9CWX9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ddx47Q9CWX9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ddx47Q9CWX9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ddx47Q9CWX9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddx47Q9CWX9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddx47Q9CWX9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddx47Q9CWX9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ddx47Q9CWX9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ddx47Q9CWX9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ddx47Q9CWX9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddx47Q9CWX9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddx47Q9CWX9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddx47Q9CWX9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ddx47Q9CWX9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ddx47Q9CWX9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx47Q9CWX9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddx47Q9CWX9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx47Q9CWX9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx47Q9CWX9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddx47Q9CWX9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddx47Q9CWX9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddx47Q9CWX9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx47Q9CWX9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ddx47Q9CWX9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ddx47Q9CWX9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx47Q9CWX9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx47Q9CWX9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ddx47Q9CWX9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx47Q9CWX9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx47Q9CWX9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx47Q9CWX9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx47Q9CWX9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx47Q9CWX9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx47Q9CWX9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx47Q9CWX9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ddx47Q9CWX9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddx47Q9CWX9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx47Q9CWX9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddx47Q9CWX9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ddx47Q9CWX9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddx47Q9CWX9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddx47Q9CWX9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddx47Q9CWX9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddx47Q9CWX9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx47Q9CWX9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx47Q9CWX9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddx47Q9CWX9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ddx47Q9CWX9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ddx47Q9CWX9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx47Q9CWX9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx47Q9CWX9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddx47Q9CWX9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddx47Q9CWX9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddx47Q9CWX9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx47Q9CWX9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx47Q9CWX9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx47Q9CWX9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx47Q9CWX9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddx47Q9CWX9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddx47Q9CWX9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddx47Q9CWX9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddx47Q9CWX9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddx47Q9CWX9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddx47Q9CWX9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddx47Q9CWX9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddx47Q9CWX9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ddx47Q9CWX9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddx47Q9CWX9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ddx47Q9CWX9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
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