Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx2Q9CWK8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx2Q9CWK8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx2Q9CWK8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx2Q9CWK8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx2Q9CWK8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx2Q9CWK8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx2Q9CWK8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx2Q9CWK8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx2Q9CWK8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx2Q9CWK8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx2Q9CWK8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx2Q9CWK8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx2Q9CWK8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx2Q9CWK8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx2Q9CWK8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx2Q9CWK8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx2Q9CWK8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx2Q9CWK8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx2Q9CWK8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx2Q9CWK8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx2Q9CWK8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx2Q9CWK8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx2Q9CWK8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx2Q9CWK8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx2Q9CWK8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx2Q9CWK8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx2Q9CWK8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx2Q9CWK8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx2Q9CWK8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx2Q9CWK8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx2Q9CWK8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx2Q9CWK8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx2Q9CWK8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx2Q9CWK8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx2Q9CWK8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx2Q9CWK8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx2Q9CWK8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx2Q9CWK8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx2Q9CWK8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx2Q9CWK8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx2Q9CWK8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snx2Q9CWK8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx2Q9CWK8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx2Q9CWK8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx2Q9CWK8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx2Q9CWK8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx2Q9CWK8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx2Q9CWK8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx2Q9CWK8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx2Q9CWK8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx2Q9CWK8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx2Q9CWK8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx2Q9CWK8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx2Q9CWK8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx2Q9CWK8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx2Q9CWK8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx2Q9CWK8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx2Q9CWK8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx2Q9CWK8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx2Q9CWK8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx2Q9CWK8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx2Q9CWK8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx2Q9CWK8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx2Q9CWK8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx2Q9CWK8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx2Q9CWK8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx2Q9CWK8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx2Q9CWK8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx2Q9CWK8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx2Q9CWK8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx2Q9CWK8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx2Q9CWK8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx2Q9CWK8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx2Q9CWK8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx2Q9CWK8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx2Q9CWK8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx2Q9CWK8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx2Q9CWK8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx2Q9CWK8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx2Q9CWK8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx2Q9CWK8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx2Q9CWK8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx2Q9CWK8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx2Q9CWK8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx2Q9CWK8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx2Q9CWK8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx2Q9CWK8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx2Q9CWK8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx2Q9CWK8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx2Q9CWK8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx2Q9CWK8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx2Q9CWK8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx2Q9CWK8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx2Q9CWK8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx2Q9CWK8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx2Q9CWK8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx2Q9CWK8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx2Q9CWK8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx2Q9CWK8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1736.9 ms