Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH6

Psma8, Proteasome subunit alpha type-7-like, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma8Q9CWH6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psma8Q9CWH6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psma8Q9CWH6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psma8Q9CWH6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psma8Q9CWH6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psma8Q9CWH6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psma8Q9CWH6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psma8Q9CWH6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psma8Q9CWH6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psma8Q9CWH6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psma8Q9CWH6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psma8Q9CWH6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Psma8Q9CWH6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psma8Q9CWH6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psma8Q9CWH6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psma8Q9CWH6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psma8Q9CWH6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psma8Q9CWH6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psma8Q9CWH6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psma8Q9CWH6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psma8Q9CWH6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psma8Q9CWH6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psma8Q9CWH6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psma8Q9CWH6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Psma8Q9CWH6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Psma8Q9CWH6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Psma8Q9CWH6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Psma8Q9CWH6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Psma8Q9CWH6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Psma8Q9CWH6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Psma8Q9CWH6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Psma8Q9CWH6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Psma8Q9CWH6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Psma8Q9CWH6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psma8Q9CWH6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psma8Q9CWH6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psma8Q9CWH6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psma8Q9CWH6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psma8Q9CWH6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psma8Q9CWH6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psma8Q9CWH6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psma8Q9CWH6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psma8Q9CWH6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psma8Q9CWH6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psma8Q9CWH6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psma8Q9CWH6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psma8Q9CWH6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psma8Q9CWH6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Psma8Q9CWH6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Psma8Q9CWH6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Psma8Q9CWH6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psma8Q9CWH6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psma8Q9CWH6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psma8Q9CWH6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psma8Q9CWH6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psma8Q9CWH6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psma8Q9CWH6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psma8Q9CWH6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psma8Q9CWH6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psma8Q9CWH6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psma8Q9CWH6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psma8Q9CWH6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psma8Q9CWH6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psma8Q9CWH6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Psma8Q9CWH6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Psma8Q9CWH6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psma8Q9CWH6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psma8Q9CWH6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psma8Q9CWH6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psma8Q9CWH6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Psma8Q9CWH6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Psma8Q9CWH6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psma8Q9CWH6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psma8Q9CWH6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psma8Q9CWH6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psma8Q9CWH6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psma8Q9CWH6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psma8Q9CWH6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psma8Q9CWH6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psma8Q9CWH6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psma8Q9CWH6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psma8Q9CWH6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psma8Q9CWH6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psma8Q9CWH6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psma8Q9CWH6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psma8Q9CWH6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psma8Q9CWH6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psma8Q9CWH6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psma8Q9CWH6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psma8Q9CWH6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psma8Q9CWH6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psma8Q9CWH6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Psma8Q9CWH6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Psma8Q9CWH6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psma8Q9CWH6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psma8Q9CWH6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psma8Q9CWH6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psma8Q9CWH6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psma8Q9CWH6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psma8Q9CWH6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.4 ms