Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930524J08RikQ9CUJ5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930524J08RikQ9CUJ5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930524J08RikQ9CUJ5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930524J08RikQ9CUJ5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930524J08RikQ9CUJ5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930524J08RikQ9CUJ5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930524J08RikQ9CUJ5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930524J08RikQ9CUJ5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930524J08RikQ9CUJ5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930524J08RikQ9CUJ5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930524J08RikQ9CUJ5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930524J08RikQ9CUJ5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930524J08RikQ9CUJ5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930524J08RikQ9CUJ5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930524J08RikQ9CUJ5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930524J08RikQ9CUJ5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930524J08RikQ9CUJ5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930524J08RikQ9CUJ5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930524J08RikQ9CUJ5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930524J08RikQ9CUJ5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930524J08RikQ9CUJ5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930524J08RikQ9CUJ5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
4930524J08RikQ9CUJ5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930524J08RikQ9CUJ5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930524J08RikQ9CUJ5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
4930524J08RikQ9CUJ5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930524J08RikQ9CUJ5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930524J08RikQ9CUJ5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930524J08RikQ9CUJ5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930524J08RikQ9CUJ5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930524J08RikQ9CUJ5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930524J08RikQ9CUJ5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930524J08RikQ9CUJ5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930524J08RikQ9CUJ5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930524J08RikQ9CUJ5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930524J08RikQ9CUJ5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930524J08RikQ9CUJ5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930524J08RikQ9CUJ5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930524J08RikQ9CUJ5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930524J08RikQ9CUJ5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930524J08RikQ9CUJ5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930524J08RikQ9CUJ5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930524J08RikQ9CUJ5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930524J08RikQ9CUJ5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930524J08RikQ9CUJ5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930524J08RikQ9CUJ5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930524J08RikQ9CUJ5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930524J08RikQ9CUJ5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930524J08RikQ9CUJ5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930524J08RikQ9CUJ5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930524J08RikQ9CUJ5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930524J08RikQ9CUJ5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930524J08RikQ9CUJ5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930524J08RikQ9CUJ5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930524J08RikQ9CUJ5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930524J08RikQ9CUJ5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930524J08RikQ9CUJ5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930524J08RikQ9CUJ5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930524J08RikQ9CUJ5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930524J08RikQ9CUJ5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930524J08RikQ9CUJ5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4930524J08RikQ9CUJ5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930524J08RikQ9CUJ5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930524J08RikQ9CUJ5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930524J08RikQ9CUJ5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930524J08RikQ9CUJ5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930524J08RikQ9CUJ5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930524J08RikQ9CUJ5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4930524J08RikQ9CUJ5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930524J08RikQ9CUJ5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930524J08RikQ9CUJ5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930524J08RikQ9CUJ5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930524J08RikQ9CUJ5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930524J08RikQ9CUJ5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930524J08RikQ9CUJ5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930524J08RikQ9CUJ5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930524J08RikQ9CUJ5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930524J08RikQ9CUJ5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930524J08RikQ9CUJ5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930524J08RikQ9CUJ5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930524J08RikQ9CUJ5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930524J08RikQ9CUJ5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930524J08RikQ9CUJ5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930524J08RikQ9CUJ5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms