Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msmo1Q9CRA4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Msmo1Q9CRA4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msmo1Q9CRA4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msmo1Q9CRA4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Msmo1Q9CRA4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Msmo1Q9CRA4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Msmo1Q9CRA4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msmo1Q9CRA4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Msmo1Q9CRA4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Msmo1Q9CRA4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msmo1Q9CRA4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msmo1Q9CRA4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msmo1Q9CRA4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msmo1Q9CRA4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msmo1Q9CRA4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msmo1Q9CRA4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msmo1Q9CRA4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msmo1Q9CRA4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msmo1Q9CRA4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msmo1Q9CRA4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msmo1Q9CRA4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msmo1Q9CRA4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msmo1Q9CRA4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msmo1Q9CRA4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msmo1Q9CRA4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msmo1Q9CRA4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msmo1Q9CRA4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msmo1Q9CRA4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msmo1Q9CRA4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msmo1Q9CRA4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Msmo1Q9CRA4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Msmo1Q9CRA4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Msmo1Q9CRA4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msmo1Q9CRA4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msmo1Q9CRA4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msmo1Q9CRA4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msmo1Q9CRA4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msmo1Q9CRA4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Msmo1Q9CRA4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Msmo1Q9CRA4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Msmo1Q9CRA4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msmo1Q9CRA4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msmo1Q9CRA4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Msmo1Q9CRA4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Msmo1Q9CRA4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msmo1Q9CRA4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Msmo1Q9CRA4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msmo1Q9CRA4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msmo1Q9CRA4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msmo1Q9CRA4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msmo1Q9CRA4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Msmo1Q9CRA4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Msmo1Q9CRA4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Msmo1Q9CRA4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msmo1Q9CRA4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msmo1Q9CRA4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msmo1Q9CRA4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Msmo1Q9CRA4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msmo1Q9CRA4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msmo1Q9CRA4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Msmo1Q9CRA4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msmo1Q9CRA4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msmo1Q9CRA4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msmo1Q9CRA4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msmo1Q9CRA4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Msmo1Q9CRA4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msmo1Q9CRA4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msmo1Q9CRA4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Msmo1Q9CRA4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msmo1Q9CRA4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Msmo1Q9CRA4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msmo1Q9CRA4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msmo1Q9CRA4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msmo1Q9CRA4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msmo1Q9CRA4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msmo1Q9CRA4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Msmo1Q9CRA4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msmo1Q9CRA4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Msmo1Q9CRA4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msmo1Q9CRA4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msmo1Q9CRA4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Msmo1Q9CRA4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msmo1Q9CRA4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msmo1Q9CRA4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Msmo1Q9CRA4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msmo1Q9CRA4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msmo1Q9CRA4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msmo1Q9CRA4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msmo1Q9CRA4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msmo1Q9CRA4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msmo1Q9CRA4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Msmo1Q9CRA4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Msmo1Q9CRA4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msmo1Q9CRA4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msmo1Q9CRA4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msmo1Q9CRA4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msmo1Q9CRA4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msmo1Q9CRA4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msmo1Q9CRA4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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