Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc96Q9CR92 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc96Q9CR92 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc96Q9CR92 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc96Q9CR92 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc96Q9CR92 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc96Q9CR92 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc96Q9CR92 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc96Q9CR92 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc96Q9CR92 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc96Q9CR92 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc96Q9CR92 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ccdc96Q9CR92 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc96Q9CR92 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc96Q9CR92 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc96Q9CR92 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc96Q9CR92 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc96Q9CR92 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc96Q9CR92 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc96Q9CR92 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc96Q9CR92 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc96Q9CR92 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc96Q9CR92 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc96Q9CR92 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc96Q9CR92 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc96Q9CR92 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc96Q9CR92 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc96Q9CR92 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc96Q9CR92 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc96Q9CR92 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc96Q9CR92 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc96Q9CR92 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc96Q9CR92 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc96Q9CR92 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc96Q9CR92 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc96Q9CR92 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc96Q9CR92 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc96Q9CR92 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc96Q9CR92 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc96Q9CR92 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc96Q9CR92 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc96Q9CR92 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc96Q9CR92 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc96Q9CR92 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc96Q9CR92 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc96Q9CR92 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc96Q9CR92 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc96Q9CR92 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc96Q9CR92 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc96Q9CR92 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc96Q9CR92 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc96Q9CR92 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc96Q9CR92 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc96Q9CR92 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc96Q9CR92 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc96Q9CR92 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc96Q9CR92 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc96Q9CR92 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc96Q9CR92 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc96Q9CR92 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc96Q9CR92 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc96Q9CR92 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc96Q9CR92 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc96Q9CR92 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc96Q9CR92 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc96Q9CR92 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ccdc96Q9CR92 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc96Q9CR92 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc96Q9CR92 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc96Q9CR92 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc96Q9CR92 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc96Q9CR92 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc96Q9CR92 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc96Q9CR92 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc96Q9CR92 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc96Q9CR92 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc96Q9CR92 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc96Q9CR92 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc96Q9CR92 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc96Q9CR92 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc96Q9CR92 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc96Q9CR92 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc96Q9CR92 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc96Q9CR92 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc96Q9CR92 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc96Q9CR92 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc96Q9CR92 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc96Q9CR92 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc96Q9CR92 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc96Q9CR92 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc96Q9CR92 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc96Q9CR92 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc96Q9CR92 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc96Q9CR92 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc96Q9CR92 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc96Q9CR92 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc96Q9CR92 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc96Q9CR92 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc96Q9CR92 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc96Q9CR92 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms