Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR36

Gkn1, Gastrokine-1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn1Q9CR36 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gkn1Q9CR36 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gkn1Q9CR36 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gkn1Q9CR36 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gkn1Q9CR36 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gkn1Q9CR36 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gkn1Q9CR36 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gkn1Q9CR36 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gkn1Q9CR36 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gkn1Q9CR36 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gkn1Q9CR36 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gkn1Q9CR36 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gkn1Q9CR36 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gkn1Q9CR36 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gkn1Q9CR36 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gkn1Q9CR36 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gkn1Q9CR36 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gkn1Q9CR36 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gkn1Q9CR36 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gkn1Q9CR36 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gkn1Q9CR36 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gkn1Q9CR36 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gkn1Q9CR36 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gkn1Q9CR36 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gkn1Q9CR36 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gkn1Q9CR36 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gkn1Q9CR36 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gkn1Q9CR36 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gkn1Q9CR36 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gkn1Q9CR36 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gkn1Q9CR36 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gkn1Q9CR36 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gkn1Q9CR36 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gkn1Q9CR36 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gkn1Q9CR36 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gkn1Q9CR36 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gkn1Q9CR36 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gkn1Q9CR36 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gkn1Q9CR36 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gkn1Q9CR36 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gkn1Q9CR36 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gkn1Q9CR36 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gkn1Q9CR36 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gkn1Q9CR36 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gkn1Q9CR36 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gkn1Q9CR36 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gkn1Q9CR36 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gkn1Q9CR36 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gkn1Q9CR36 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gkn1Q9CR36 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gkn1Q9CR36 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gkn1Q9CR36 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gkn1Q9CR36 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gkn1Q9CR36 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Gkn1Q9CR36 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gkn1Q9CR36 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gkn1Q9CR36 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gkn1Q9CR36 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gkn1Q9CR36 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gkn1Q9CR36 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gkn1Q9CR36 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gkn1Q9CR36 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gkn1Q9CR36 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gkn1Q9CR36 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gkn1Q9CR36 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gkn1Q9CR36 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gkn1Q9CR36 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gkn1Q9CR36 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gkn1Q9CR36 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gkn1Q9CR36 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gkn1Q9CR36 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gkn1Q9CR36 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gkn1Q9CR36 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gkn1Q9CR36 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gkn1Q9CR36 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gkn1Q9CR36 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gkn1Q9CR36 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gkn1Q9CR36 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gkn1Q9CR36 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gkn1Q9CR36 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gkn1Q9CR36 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gkn1Q9CR36 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gkn1Q9CR36 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gkn1Q9CR36 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gkn1Q9CR36 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gkn1Q9CR36 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gkn1Q9CR36 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gkn1Q9CR36 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gkn1Q9CR36 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gkn1Q9CR36 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gkn1Q9CR36 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gkn1Q9CR36 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gkn1Q9CR36 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gkn1Q9CR36 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gkn1Q9CR36 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gkn1Q9CR36 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkn1Q9CR36 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkn1Q9CR36 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkn1Q9CR36 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gkn1Q9CR36 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms