Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR23

Tmem9, Transmembrane protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem9Q9CR23 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem9Q9CR23 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem9Q9CR23 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem9Q9CR23 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem9Q9CR23 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem9Q9CR23 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem9Q9CR23 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem9Q9CR23 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem9Q9CR23 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem9Q9CR23 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem9Q9CR23 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem9Q9CR23 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem9Q9CR23 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem9Q9CR23 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem9Q9CR23 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem9Q9CR23 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem9Q9CR23 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem9Q9CR23 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem9Q9CR23 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem9Q9CR23 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem9Q9CR23 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem9Q9CR23 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem9Q9CR23 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem9Q9CR23 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem9Q9CR23 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem9Q9CR23 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem9Q9CR23 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem9Q9CR23 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem9Q9CR23 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem9Q9CR23 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem9Q9CR23 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem9Q9CR23 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem9Q9CR23 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem9Q9CR23 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem9Q9CR23 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem9Q9CR23 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem9Q9CR23 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem9Q9CR23 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem9Q9CR23 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem9Q9CR23 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem9Q9CR23 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem9Q9CR23 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmem9Q9CR23 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem9Q9CR23 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem9Q9CR23 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem9Q9CR23 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem9Q9CR23 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem9Q9CR23 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem9Q9CR23 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem9Q9CR23 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem9Q9CR23 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem9Q9CR23 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem9Q9CR23 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem9Q9CR23 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem9Q9CR23 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem9Q9CR23 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem9Q9CR23 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem9Q9CR23 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem9Q9CR23 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem9Q9CR23 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem9Q9CR23 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem9Q9CR23 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem9Q9CR23 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem9Q9CR23 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem9Q9CR23 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem9Q9CR23 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem9Q9CR23 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem9Q9CR23 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem9Q9CR23 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem9Q9CR23 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem9Q9CR23 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem9Q9CR23 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem9Q9CR23 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem9Q9CR23 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem9Q9CR23 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem9Q9CR23 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem9Q9CR23 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem9Q9CR23 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem9Q9CR23 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem9Q9CR23 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem9Q9CR23 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem9Q9CR23 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem9Q9CR23 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem9Q9CR23 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem9Q9CR23 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem9Q9CR23 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem9Q9CR23 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem9Q9CR23 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem9Q9CR23 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem9Q9CR23 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem9Q9CR23 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem9Q9CR23 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem9Q9CR23 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem9Q9CR23 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem9Q9CR23 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem9Q9CR23 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem9Q9CR23 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem9Q9CR23 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem9Q9CR23 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem9Q9CR23 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms