Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR21

Ndufab1, Acyl carrier protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufab1Q9CR21 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ndufab1Q9CR21 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ndufab1Q9CR21 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ndufab1Q9CR21 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ndufab1Q9CR21 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ndufab1Q9CR21 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ndufab1Q9CR21 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ndufab1Q9CR21 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ndufab1Q9CR21 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ndufab1Q9CR21 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ndufab1Q9CR21 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ndufab1Q9CR21 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ndufab1Q9CR21 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ndufab1Q9CR21 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ndufab1Q9CR21 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ndufab1Q9CR21 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ndufab1Q9CR21 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ndufab1Q9CR21 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ndufab1Q9CR21 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ndufab1Q9CR21 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ndufab1Q9CR21 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ndufab1Q9CR21 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ndufab1Q9CR21 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ndufab1Q9CR21 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ndufab1Q9CR21 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ndufab1Q9CR21 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ndufab1Q9CR21 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ndufab1Q9CR21 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ndufab1Q9CR21 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ndufab1Q9CR21 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ndufab1Q9CR21 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ndufab1Q9CR21 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ndufab1Q9CR21 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ndufab1Q9CR21 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ndufab1Q9CR21 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ndufab1Q9CR21 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ndufab1Q9CR21 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ndufab1Q9CR21 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ndufab1Q9CR21 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ndufab1Q9CR21 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ndufab1Q9CR21 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ndufab1Q9CR21 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ndufab1Q9CR21 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ndufab1Q9CR21 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ndufab1Q9CR21 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ndufab1Q9CR21 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ndufab1Q9CR21 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ndufab1Q9CR21 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ndufab1Q9CR21 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ndufab1Q9CR21 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ndufab1Q9CR21 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ndufab1Q9CR21 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ndufab1Q9CR21 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ndufab1Q9CR21 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ndufab1Q9CR21 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ndufab1Q9CR21 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ndufab1Q9CR21 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ndufab1Q9CR21 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ndufab1Q9CR21 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ndufab1Q9CR21 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ndufab1Q9CR21 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ndufab1Q9CR21 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ndufab1Q9CR21 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ndufab1Q9CR21 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ndufab1Q9CR21 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ndufab1Q9CR21 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ndufab1Q9CR21 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ndufab1Q9CR21 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ndufab1Q9CR21 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ndufab1Q9CR21 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ndufab1Q9CR21 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ndufab1Q9CR21 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ndufab1Q9CR21 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ndufab1Q9CR21 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ndufab1Q9CR21 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ndufab1Q9CR21 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ndufab1Q9CR21 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ndufab1Q9CR21 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ndufab1Q9CR21 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ndufab1Q9CR21 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ndufab1Q9CR21 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ndufab1Q9CR21 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ndufab1Q9CR21 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ndufab1Q9CR21 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ndufab1Q9CR21 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ndufab1Q9CR21 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ndufab1Q9CR21 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ndufab1Q9CR21 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ndufab1Q9CR21 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ndufab1Q9CR21 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ndufab1Q9CR21 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ndufab1Q9CR21 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ndufab1Q9CR21 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ndufab1Q9CR21 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ndufab1Q9CR21 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ndufab1Q9CR21 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ndufab1Q9CR21 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ndufab1Q9CR21 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ndufab1Q9CR21 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ndufab1Q9CR21 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms