Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifitm3Q9CQW9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifitm3Q9CQW9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifitm3Q9CQW9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifitm3Q9CQW9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifitm3Q9CQW9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifitm3Q9CQW9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifitm3Q9CQW9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifitm3Q9CQW9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifitm3Q9CQW9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifitm3Q9CQW9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifitm3Q9CQW9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ifitm3Q9CQW9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifitm3Q9CQW9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifitm3Q9CQW9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifitm3Q9CQW9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifitm3Q9CQW9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifitm3Q9CQW9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifitm3Q9CQW9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifitm3Q9CQW9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifitm3Q9CQW9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifitm3Q9CQW9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifitm3Q9CQW9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifitm3Q9CQW9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifitm3Q9CQW9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifitm3Q9CQW9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifitm3Q9CQW9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifitm3Q9CQW9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ifitm3Q9CQW9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifitm3Q9CQW9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifitm3Q9CQW9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifitm3Q9CQW9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifitm3Q9CQW9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifitm3Q9CQW9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifitm3Q9CQW9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifitm3Q9CQW9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifitm3Q9CQW9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifitm3Q9CQW9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifitm3Q9CQW9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifitm3Q9CQW9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifitm3Q9CQW9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifitm3Q9CQW9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifitm3Q9CQW9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifitm3Q9CQW9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifitm3Q9CQW9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifitm3Q9CQW9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifitm3Q9CQW9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifitm3Q9CQW9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifitm3Q9CQW9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifitm3Q9CQW9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifitm3Q9CQW9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifitm3Q9CQW9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifitm3Q9CQW9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifitm3Q9CQW9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifitm3Q9CQW9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifitm3Q9CQW9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifitm3Q9CQW9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifitm3Q9CQW9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifitm3Q9CQW9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifitm3Q9CQW9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifitm3Q9CQW9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifitm3Q9CQW9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifitm3Q9CQW9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifitm3Q9CQW9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifitm3Q9CQW9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifitm3Q9CQW9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifitm3Q9CQW9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifitm3Q9CQW9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifitm3Q9CQW9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifitm3Q9CQW9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifitm3Q9CQW9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifitm3Q9CQW9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifitm3Q9CQW9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifitm3Q9CQW9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ifitm3Q9CQW9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ifitm3Q9CQW9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ifitm3Q9CQW9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ifitm3Q9CQW9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifitm3Q9CQW9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifitm3Q9CQW9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifitm3Q9CQW9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifitm3Q9CQW9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifitm3Q9CQW9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifitm3Q9CQW9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifitm3Q9CQW9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifitm3Q9CQW9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifitm3Q9CQW9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifitm3Q9CQW9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifitm3Q9CQW9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifitm3Q9CQW9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifitm3Q9CQW9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifitm3Q9CQW9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ifitm3Q9CQW9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifitm3Q9CQW9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ifitm3Q9CQW9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ifitm3Q9CQW9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ifitm3Q9CQW9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ifitm3Q9CQW9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifitm3Q9CQW9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifitm3Q9CQW9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms