Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ykt6Q9CQW1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ykt6Q9CQW1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ykt6Q9CQW1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ykt6Q9CQW1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ykt6Q9CQW1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ykt6Q9CQW1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ykt6Q9CQW1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ykt6Q9CQW1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ykt6Q9CQW1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ykt6Q9CQW1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ykt6Q9CQW1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ykt6Q9CQW1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ykt6Q9CQW1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ykt6Q9CQW1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ykt6Q9CQW1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ykt6Q9CQW1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ykt6Q9CQW1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ykt6Q9CQW1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ykt6Q9CQW1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ykt6Q9CQW1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ykt6Q9CQW1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ykt6Q9CQW1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ykt6Q9CQW1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ykt6Q9CQW1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ykt6Q9CQW1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ykt6Q9CQW1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ykt6Q9CQW1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ykt6Q9CQW1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ykt6Q9CQW1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ykt6Q9CQW1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ykt6Q9CQW1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ykt6Q9CQW1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ykt6Q9CQW1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ykt6Q9CQW1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ykt6Q9CQW1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ykt6Q9CQW1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ykt6Q9CQW1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ykt6Q9CQW1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ykt6Q9CQW1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ykt6Q9CQW1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ykt6Q9CQW1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ykt6Q9CQW1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ykt6Q9CQW1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ykt6Q9CQW1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ykt6Q9CQW1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ykt6Q9CQW1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ykt6Q9CQW1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ykt6Q9CQW1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ykt6Q9CQW1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ykt6Q9CQW1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ykt6Q9CQW1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ykt6Q9CQW1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ykt6Q9CQW1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ykt6Q9CQW1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ykt6Q9CQW1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ykt6Q9CQW1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ykt6Q9CQW1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ykt6Q9CQW1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ykt6Q9CQW1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ykt6Q9CQW1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ykt6Q9CQW1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ykt6Q9CQW1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ykt6Q9CQW1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ykt6Q9CQW1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ykt6Q9CQW1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ykt6Q9CQW1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ykt6Q9CQW1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ykt6Q9CQW1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ykt6Q9CQW1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ykt6Q9CQW1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ykt6Q9CQW1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ykt6Q9CQW1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ykt6Q9CQW1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ykt6Q9CQW1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ykt6Q9CQW1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ykt6Q9CQW1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ykt6Q9CQW1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ykt6Q9CQW1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ykt6Q9CQW1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ykt6Q9CQW1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ykt6Q9CQW1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ykt6Q9CQW1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ykt6Q9CQW1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ykt6Q9CQW1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ykt6Q9CQW1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ykt6Q9CQW1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ykt6Q9CQW1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ykt6Q9CQW1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ykt6Q9CQW1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ykt6Q9CQW1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ykt6Q9CQW1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ykt6Q9CQW1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ykt6Q9CQW1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ykt6Q9CQW1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ykt6Q9CQW1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ykt6Q9CQW1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ykt6Q9CQW1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ykt6Q9CQW1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ykt6Q9CQW1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms