Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snrpb2Q9CQI7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snrpb2Q9CQI7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snrpb2Q9CQI7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snrpb2Q9CQI7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snrpb2Q9CQI7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snrpb2Q9CQI7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snrpb2Q9CQI7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snrpb2Q9CQI7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snrpb2Q9CQI7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snrpb2Q9CQI7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snrpb2Q9CQI7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snrpb2Q9CQI7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snrpb2Q9CQI7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snrpb2Q9CQI7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snrpb2Q9CQI7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snrpb2Q9CQI7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snrpb2Q9CQI7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snrpb2Q9CQI7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snrpb2Q9CQI7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snrpb2Q9CQI7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snrpb2Q9CQI7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snrpb2Q9CQI7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snrpb2Q9CQI7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Snrpb2Q9CQI7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snrpb2Q9CQI7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Snrpb2Q9CQI7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snrpb2Q9CQI7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snrpb2Q9CQI7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snrpb2Q9CQI7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snrpb2Q9CQI7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snrpb2Q9CQI7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snrpb2Q9CQI7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snrpb2Q9CQI7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snrpb2Q9CQI7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snrpb2Q9CQI7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snrpb2Q9CQI7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snrpb2Q9CQI7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snrpb2Q9CQI7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snrpb2Q9CQI7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snrpb2Q9CQI7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snrpb2Q9CQI7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snrpb2Q9CQI7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snrpb2Q9CQI7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snrpb2Q9CQI7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snrpb2Q9CQI7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snrpb2Q9CQI7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snrpb2Q9CQI7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snrpb2Q9CQI7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snrpb2Q9CQI7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snrpb2Q9CQI7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snrpb2Q9CQI7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Snrpb2Q9CQI7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snrpb2Q9CQI7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snrpb2Q9CQI7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Snrpb2Q9CQI7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snrpb2Q9CQI7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snrpb2Q9CQI7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snrpb2Q9CQI7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snrpb2Q9CQI7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snrpb2Q9CQI7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snrpb2Q9CQI7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snrpb2Q9CQI7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snrpb2Q9CQI7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snrpb2Q9CQI7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snrpb2Q9CQI7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snrpb2Q9CQI7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snrpb2Q9CQI7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snrpb2Q9CQI7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Snrpb2Q9CQI7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snrpb2Q9CQI7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snrpb2Q9CQI7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snrpb2Q9CQI7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snrpb2Q9CQI7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snrpb2Q9CQI7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snrpb2Q9CQI7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snrpb2Q9CQI7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snrpb2Q9CQI7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snrpb2Q9CQI7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snrpb2Q9CQI7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snrpb2Q9CQI7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snrpb2Q9CQI7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snrpb2Q9CQI7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snrpb2Q9CQI7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snrpb2Q9CQI7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snrpb2Q9CQI7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snrpb2Q9CQI7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snrpb2Q9CQI7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snrpb2Q9CQI7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snrpb2Q9CQI7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snrpb2Q9CQI7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snrpb2Q9CQI7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snrpb2Q9CQI7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snrpb2Q9CQI7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Snrpb2Q9CQI7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snrpb2Q9CQI7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snrpb2Q9CQI7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snrpb2Q9CQI7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snrpb2Q9CQI7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snrpb2Q9CQI7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms