Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb3bpQ9CQ82 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb3bpQ9CQ82 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb3bpQ9CQ82 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb3bpQ9CQ82 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb3bpQ9CQ82 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb3bpQ9CQ82 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb3bpQ9CQ82 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb3bpQ9CQ82 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb3bpQ9CQ82 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb3bpQ9CQ82 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb3bpQ9CQ82 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb3bpQ9CQ82 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb3bpQ9CQ82 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb3bpQ9CQ82 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb3bpQ9CQ82 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb3bpQ9CQ82 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb3bpQ9CQ82 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb3bpQ9CQ82 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb3bpQ9CQ82 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb3bpQ9CQ82 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb3bpQ9CQ82 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb3bpQ9CQ82 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb3bpQ9CQ82 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb3bpQ9CQ82 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb3bpQ9CQ82 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb3bpQ9CQ82 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb3bpQ9CQ82 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb3bpQ9CQ82 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb3bpQ9CQ82 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb3bpQ9CQ82 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb3bpQ9CQ82 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb3bpQ9CQ82 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb3bpQ9CQ82 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb3bpQ9CQ82 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb3bpQ9CQ82 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb3bpQ9CQ82 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb3bpQ9CQ82 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb3bpQ9CQ82 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb3bpQ9CQ82 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb3bpQ9CQ82 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb3bpQ9CQ82 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb3bpQ9CQ82 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb3bpQ9CQ82 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb3bpQ9CQ82 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb3bpQ9CQ82 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Itgb3bpQ9CQ82 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb3bpQ9CQ82 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb3bpQ9CQ82 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb3bpQ9CQ82 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb3bpQ9CQ82 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb3bpQ9CQ82 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb3bpQ9CQ82 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb3bpQ9CQ82 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb3bpQ9CQ82 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb3bpQ9CQ82 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb3bpQ9CQ82 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb3bpQ9CQ82 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb3bpQ9CQ82 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb3bpQ9CQ82 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb3bpQ9CQ82 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Itgb3bpQ9CQ82 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb3bpQ9CQ82 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb3bpQ9CQ82 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb3bpQ9CQ82 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb3bpQ9CQ82 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb3bpQ9CQ82 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb3bpQ9CQ82 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb3bpQ9CQ82 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb3bpQ9CQ82 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb3bpQ9CQ82 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb3bpQ9CQ82 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb3bpQ9CQ82 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb3bpQ9CQ82 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb3bpQ9CQ82 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb3bpQ9CQ82 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb3bpQ9CQ82 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb3bpQ9CQ82 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb3bpQ9CQ82 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb3bpQ9CQ82 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb3bpQ9CQ82 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb3bpQ9CQ82 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb3bpQ9CQ82 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb3bpQ9CQ82 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Itgb3bpQ9CQ82 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb3bpQ9CQ82 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb3bpQ9CQ82 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb3bpQ9CQ82 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb3bpQ9CQ82 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb3bpQ9CQ82 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb3bpQ9CQ82 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb3bpQ9CQ82 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb3bpQ9CQ82 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb3bpQ9CQ82 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb3bpQ9CQ82 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb3bpQ9CQ82 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb3bpQ9CQ82 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb3bpQ9CQ82 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb3bpQ9CQ82 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb3bpQ9CQ82 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms