Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NepnQ9CQ76 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NepnQ9CQ76 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NepnQ9CQ76 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NepnQ9CQ76 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NepnQ9CQ76 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NepnQ9CQ76 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NepnQ9CQ76 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NepnQ9CQ76 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NepnQ9CQ76 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NepnQ9CQ76 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NepnQ9CQ76 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NepnQ9CQ76 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NepnQ9CQ76 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NepnQ9CQ76 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NepnQ9CQ76 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NepnQ9CQ76 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NepnQ9CQ76 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NepnQ9CQ76 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NepnQ9CQ76 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NepnQ9CQ76 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NepnQ9CQ76 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NepnQ9CQ76 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NepnQ9CQ76 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NepnQ9CQ76 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NepnQ9CQ76 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NepnQ9CQ76 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NepnQ9CQ76 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NepnQ9CQ76 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NepnQ9CQ76 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NepnQ9CQ76 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NepnQ9CQ76 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NepnQ9CQ76 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NepnQ9CQ76 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NepnQ9CQ76 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NepnQ9CQ76 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NepnQ9CQ76 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NepnQ9CQ76 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NepnQ9CQ76 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NepnQ9CQ76 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NepnQ9CQ76 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NepnQ9CQ76 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NepnQ9CQ76 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NepnQ9CQ76 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NepnQ9CQ76 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NepnQ9CQ76 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NepnQ9CQ76 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NepnQ9CQ76 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NepnQ9CQ76 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NepnQ9CQ76 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NepnQ9CQ76 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NepnQ9CQ76 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NepnQ9CQ76 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NepnQ9CQ76 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NepnQ9CQ76 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NepnQ9CQ76 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NepnQ9CQ76 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NepnQ9CQ76 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NepnQ9CQ76 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NepnQ9CQ76 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NepnQ9CQ76 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NepnQ9CQ76 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NepnQ9CQ76 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NepnQ9CQ76 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NepnQ9CQ76 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NepnQ9CQ76 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NepnQ9CQ76 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NepnQ9CQ76 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NepnQ9CQ76 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NepnQ9CQ76 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NepnQ9CQ76 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NepnQ9CQ76 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NepnQ9CQ76 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NepnQ9CQ76 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NepnQ9CQ76 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NepnQ9CQ76 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NepnQ9CQ76 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NepnQ9CQ76 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NepnQ9CQ76 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NepnQ9CQ76 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NepnQ9CQ76 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NepnQ9CQ76 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NepnQ9CQ76 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NepnQ9CQ76 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NepnQ9CQ76 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NepnQ9CQ76 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NepnQ9CQ76 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NepnQ9CQ76 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NepnQ9CQ76 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NepnQ9CQ76 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NepnQ9CQ76 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NepnQ9CQ76 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NepnQ9CQ76 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NepnQ9CQ76 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NepnQ9CQ76 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NepnQ9CQ76 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NepnQ9CQ76 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NepnQ9CQ76 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NepnQ9CQ76 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NepnQ9CQ76 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms