Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
StambpQ9CQ26 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
StambpQ9CQ26 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
StambpQ9CQ26 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
StambpQ9CQ26 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
StambpQ9CQ26 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
StambpQ9CQ26 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
StambpQ9CQ26 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
StambpQ9CQ26 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
StambpQ9CQ26 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
StambpQ9CQ26 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
StambpQ9CQ26 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
StambpQ9CQ26 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
StambpQ9CQ26 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
StambpQ9CQ26 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
StambpQ9CQ26 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
StambpQ9CQ26 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
StambpQ9CQ26 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
StambpQ9CQ26 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
StambpQ9CQ26 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
StambpQ9CQ26 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
StambpQ9CQ26 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
StambpQ9CQ26 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
StambpQ9CQ26 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
StambpQ9CQ26 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
StambpQ9CQ26 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
StambpQ9CQ26 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
StambpQ9CQ26 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
StambpQ9CQ26 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
StambpQ9CQ26 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
StambpQ9CQ26 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
StambpQ9CQ26 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
StambpQ9CQ26 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
StambpQ9CQ26 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
StambpQ9CQ26 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
StambpQ9CQ26 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
StambpQ9CQ26 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
StambpQ9CQ26 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
StambpQ9CQ26 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
StambpQ9CQ26 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
StambpQ9CQ26 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
StambpQ9CQ26 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
StambpQ9CQ26 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
StambpQ9CQ26 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
StambpQ9CQ26 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
StambpQ9CQ26 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
StambpQ9CQ26 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
StambpQ9CQ26 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
StambpQ9CQ26 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
StambpQ9CQ26 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
StambpQ9CQ26 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
StambpQ9CQ26 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
StambpQ9CQ26 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
StambpQ9CQ26 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
StambpQ9CQ26 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
StambpQ9CQ26 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
StambpQ9CQ26 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
StambpQ9CQ26 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
StambpQ9CQ26 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
StambpQ9CQ26 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
StambpQ9CQ26 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
StambpQ9CQ26 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
StambpQ9CQ26 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms