Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnaseh2cQ9CQ18 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnaseh2cQ9CQ18 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnaseh2cQ9CQ18 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnaseh2cQ9CQ18 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnaseh2cQ9CQ18 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnaseh2cQ9CQ18 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnaseh2cQ9CQ18 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnaseh2cQ9CQ18 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnaseh2cQ9CQ18 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnaseh2cQ9CQ18 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnaseh2cQ9CQ18 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnaseh2cQ9CQ18 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnaseh2cQ9CQ18 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnaseh2cQ9CQ18 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnaseh2cQ9CQ18 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnaseh2cQ9CQ18 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnaseh2cQ9CQ18 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnaseh2cQ9CQ18 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnaseh2cQ9CQ18 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnaseh2cQ9CQ18 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnaseh2cQ9CQ18 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnaseh2cQ9CQ18 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnaseh2cQ9CQ18 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnaseh2cQ9CQ18 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnaseh2cQ9CQ18 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnaseh2cQ9CQ18 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnaseh2cQ9CQ18 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnaseh2cQ9CQ18 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnaseh2cQ9CQ18 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnaseh2cQ9CQ18 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnaseh2cQ9CQ18 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnaseh2cQ9CQ18 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnaseh2cQ9CQ18 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnaseh2cQ9CQ18 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnaseh2cQ9CQ18 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnaseh2cQ9CQ18 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnaseh2cQ9CQ18 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnaseh2cQ9CQ18 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnaseh2cQ9CQ18 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnaseh2cQ9CQ18 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnaseh2cQ9CQ18 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnaseh2cQ9CQ18 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnaseh2cQ9CQ18 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnaseh2cQ9CQ18 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnaseh2cQ9CQ18 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnaseh2cQ9CQ18 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnaseh2cQ9CQ18 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnaseh2cQ9CQ18 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnaseh2cQ9CQ18 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnaseh2cQ9CQ18 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnaseh2cQ9CQ18 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnaseh2cQ9CQ18 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnaseh2cQ9CQ18 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnaseh2cQ9CQ18 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnaseh2cQ9CQ18 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnaseh2cQ9CQ18 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnaseh2cQ9CQ18 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnaseh2cQ9CQ18 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnaseh2cQ9CQ18 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnaseh2cQ9CQ18 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnaseh2cQ9CQ18 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnaseh2cQ9CQ18 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnaseh2cQ9CQ18 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnaseh2cQ9CQ18 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnaseh2cQ9CQ18 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnaseh2cQ9CQ18 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnaseh2cQ9CQ18 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnaseh2cQ9CQ18 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnaseh2cQ9CQ18 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnaseh2cQ9CQ18 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnaseh2cQ9CQ18 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnaseh2cQ9CQ18 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnaseh2cQ9CQ18 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rnaseh2cQ9CQ18 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnaseh2cQ9CQ18 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnaseh2cQ9CQ18 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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