Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Commd4Q9CQ02 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Commd4Q9CQ02 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Commd4Q9CQ02 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Commd4Q9CQ02 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Commd4Q9CQ02 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Commd4Q9CQ02 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Commd4Q9CQ02 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Commd4Q9CQ02 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Commd4Q9CQ02 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Commd4Q9CQ02 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Commd4Q9CQ02 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Commd4Q9CQ02 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Commd4Q9CQ02 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Commd4Q9CQ02 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Commd4Q9CQ02 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Commd4Q9CQ02 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Commd4Q9CQ02 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Commd4Q9CQ02 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Commd4Q9CQ02 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Commd4Q9CQ02 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Commd4Q9CQ02 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Commd4Q9CQ02 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Commd4Q9CQ02 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Commd4Q9CQ02 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Commd4Q9CQ02 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Commd4Q9CQ02 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Commd4Q9CQ02 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Commd4Q9CQ02 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Commd4Q9CQ02 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Commd4Q9CQ02 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Commd4Q9CQ02 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Commd4Q9CQ02 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Commd4Q9CQ02 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Commd4Q9CQ02 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Commd4Q9CQ02 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Commd4Q9CQ02 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Commd4Q9CQ02 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Commd4Q9CQ02 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Commd4Q9CQ02 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Commd4Q9CQ02 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Commd4Q9CQ02 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Commd4Q9CQ02 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Commd4Q9CQ02 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Commd4Q9CQ02 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Commd4Q9CQ02 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Commd4Q9CQ02 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Commd4Q9CQ02 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Commd4Q9CQ02 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Commd4Q9CQ02 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Commd4Q9CQ02 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Commd4Q9CQ02 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Commd4Q9CQ02 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Commd4Q9CQ02 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Commd4Q9CQ02 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Commd4Q9CQ02 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Commd4Q9CQ02 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Commd4Q9CQ02 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Commd4Q9CQ02 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Commd4Q9CQ02 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Commd4Q9CQ02 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Commd4Q9CQ02 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Commd4Q9CQ02 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Commd4Q9CQ02 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Commd4Q9CQ02 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Commd4Q9CQ02 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Commd4Q9CQ02 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Commd4Q9CQ02 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Commd4Q9CQ02 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Commd4Q9CQ02 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Commd4Q9CQ02 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Commd4Q9CQ02 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Commd4Q9CQ02 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Commd4Q9CQ02 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Commd4Q9CQ02 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Commd4Q9CQ02 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Commd4Q9CQ02 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Commd4Q9CQ02 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Commd4Q9CQ02 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Commd4Q9CQ02 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Commd4Q9CQ02 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Commd4Q9CQ02 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Commd4Q9CQ02 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Commd4Q9CQ02 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Commd4Q9CQ02 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Commd4Q9CQ02 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Commd4Q9CQ02 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Commd4Q9CQ02 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Commd4Q9CQ02 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Commd4Q9CQ02 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Commd4Q9CQ02 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Commd4Q9CQ02 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Commd4Q9CQ02 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Commd4Q9CQ02 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Commd4Q9CQ02 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Commd4Q9CQ02 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Commd4Q9CQ02 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Commd4Q9CQ02 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Commd4Q9CQ02 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Commd4Q9CQ02 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms