Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPN7

1810009J06Rik, RIKEN cDNA 1810009J06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810009J06RikQ9CPN7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1810009J06RikQ9CPN7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1810009J06RikQ9CPN7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
1810009J06RikQ9CPN7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1810009J06RikQ9CPN7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
1810009J06RikQ9CPN7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1810009J06RikQ9CPN7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
1810009J06RikQ9CPN7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1810009J06RikQ9CPN7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
1810009J06RikQ9CPN7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1810009J06RikQ9CPN7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1810009J06RikQ9CPN7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1810009J06RikQ9CPN7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1810009J06RikQ9CPN7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1810009J06RikQ9CPN7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1810009J06RikQ9CPN7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1810009J06RikQ9CPN7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1810009J06RikQ9CPN7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1810009J06RikQ9CPN7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
1810009J06RikQ9CPN7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
1810009J06RikQ9CPN7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
1810009J06RikQ9CPN7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
1810009J06RikQ9CPN7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
1810009J06RikQ9CPN7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
1810009J06RikQ9CPN7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1810009J06RikQ9CPN7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1810009J06RikQ9CPN7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
1810009J06RikQ9CPN7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
1810009J06RikQ9CPN7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
1810009J06RikQ9CPN7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
1810009J06RikQ9CPN7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1810009J06RikQ9CPN7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1810009J06RikQ9CPN7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1810009J06RikQ9CPN7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1810009J06RikQ9CPN7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1810009J06RikQ9CPN7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1810009J06RikQ9CPN7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
1810009J06RikQ9CPN7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1810009J06RikQ9CPN7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1810009J06RikQ9CPN7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
1810009J06RikQ9CPN7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1810009J06RikQ9CPN7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
1810009J06RikQ9CPN7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1810009J06RikQ9CPN7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1810009J06RikQ9CPN7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1810009J06RikQ9CPN7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1810009J06RikQ9CPN7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1810009J06RikQ9CPN7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
1810009J06RikQ9CPN7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
1810009J06RikQ9CPN7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1810009J06RikQ9CPN7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1810009J06RikQ9CPN7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1810009J06RikQ9CPN7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1810009J06RikQ9CPN7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
1810009J06RikQ9CPN7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
1810009J06RikQ9CPN7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1810009J06RikQ9CPN7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1810009J06RikQ9CPN7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1810009J06RikQ9CPN7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
1810009J06RikQ9CPN7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1810009J06RikQ9CPN7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1810009J06RikQ9CPN7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1810009J06RikQ9CPN7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1810009J06RikQ9CPN7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
1810009J06RikQ9CPN7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1810009J06RikQ9CPN7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1810009J06RikQ9CPN7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1810009J06RikQ9CPN7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
1810009J06RikQ9CPN7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1810009J06RikQ9CPN7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1810009J06RikQ9CPN7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1810009J06RikQ9CPN7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1810009J06RikQ9CPN7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1810009J06RikQ9CPN7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
1810009J06RikQ9CPN7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
1810009J06RikQ9CPN7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1810009J06RikQ9CPN7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
1810009J06RikQ9CPN7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
1810009J06RikQ9CPN7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
1810009J06RikQ9CPN7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1810009J06RikQ9CPN7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
1810009J06RikQ9CPN7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1810009J06RikQ9CPN7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1810009J06RikQ9CPN7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1810009J06RikQ9CPN7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
1810009J06RikQ9CPN7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1810009J06RikQ9CPN7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
1810009J06RikQ9CPN7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22■■□□□ 1.11
1810009J06RikQ9CPN7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1810009J06RikQ9CPN7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1810009J06RikQ9CPN7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1810009J06RikQ9CPN7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1810009J06RikQ9CPN7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1810009J06RikQ9CPN7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1810009J06RikQ9CPN7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1810009J06RikQ9CPN7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
1810009J06RikQ9CPN7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1810009J06RikQ9CPN7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1810009J06RikQ9CPN7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1810009J06RikQ9CPN7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.1 ms