Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU7

Bap1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap1Q99PU7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Bap1Q99PU7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Bap1Q99PU7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Bap1Q99PU7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Bap1Q99PU7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Bap1Q99PU7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Bap1Q99PU7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Bap1Q99PU7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Bap1Q99PU7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Bap1Q99PU7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Bap1Q99PU7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Bap1Q99PU7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Bap1Q99PU7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Bap1Q99PU7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Bap1Q99PU7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Bap1Q99PU7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Bap1Q99PU7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Bap1Q99PU7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Bap1Q99PU7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Bap1Q99PU7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Bap1Q99PU7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Bap1Q99PU7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Bap1Q99PU7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Bap1Q99PU7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Bap1Q99PU7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Bap1Q99PU7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Bap1Q99PU7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Bap1Q99PU7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Bap1Q99PU7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Bap1Q99PU7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Bap1Q99PU7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Bap1Q99PU7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Bap1Q99PU7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Bap1Q99PU7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Bap1Q99PU7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Bap1Q99PU7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Bap1Q99PU7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Bap1Q99PU7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Bap1Q99PU7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Bap1Q99PU7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Bap1Q99PU7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Bap1Q99PU7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Bap1Q99PU7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Bap1Q99PU7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Bap1Q99PU7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Bap1Q99PU7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Bap1Q99PU7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Bap1Q99PU7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Bap1Q99PU7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Bap1Q99PU7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Bap1Q99PU7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Bap1Q99PU7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Bap1Q99PU7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Bap1Q99PU7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Bap1Q99PU7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Bap1Q99PU7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Bap1Q99PU7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Bap1Q99PU7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Bap1Q99PU7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Bap1Q99PU7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Bap1Q99PU7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Bap1Q99PU7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Bap1Q99PU7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Bap1Q99PU7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Bap1Q99PU7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Bap1Q99PU7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Bap1Q99PU7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Bap1Q99PU7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Bap1Q99PU7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Bap1Q99PU7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Bap1Q99PU7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Bap1Q99PU7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Bap1Q99PU7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Bap1Q99PU7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Bap1Q99PU7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Bap1Q99PU7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Bap1Q99PU7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Bap1Q99PU7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Bap1Q99PU7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Bap1Q99PU7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Bap1Q99PU7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Bap1Q99PU7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Bap1Q99PU7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Bap1Q99PU7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Bap1Q99PU7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Bap1Q99PU7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Bap1Q99PU7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Bap1Q99PU7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Bap1Q99PU7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Bap1Q99PU7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Bap1Q99PU7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Bap1Q99PU7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Bap1Q99PU7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Bap1Q99PU7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Bap1Q99PU7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Bap1Q99PU7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Bap1Q99PU7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Bap1Q99PU7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Bap1Q99PU7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Bap1Q99PU7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms