Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930550L24RikQ99PA7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930550L24RikQ99PA7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930550L24RikQ99PA7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930550L24RikQ99PA7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930550L24RikQ99PA7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930550L24RikQ99PA7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930550L24RikQ99PA7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930550L24RikQ99PA7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930550L24RikQ99PA7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930550L24RikQ99PA7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930550L24RikQ99PA7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930550L24RikQ99PA7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930550L24RikQ99PA7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930550L24RikQ99PA7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930550L24RikQ99PA7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930550L24RikQ99PA7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930550L24RikQ99PA7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930550L24RikQ99PA7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930550L24RikQ99PA7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930550L24RikQ99PA7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930550L24RikQ99PA7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
4930550L24RikQ99PA7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
4930550L24RikQ99PA7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930550L24RikQ99PA7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930550L24RikQ99PA7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930550L24RikQ99PA7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930550L24RikQ99PA7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930550L24RikQ99PA7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930550L24RikQ99PA7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930550L24RikQ99PA7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930550L24RikQ99PA7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930550L24RikQ99PA7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930550L24RikQ99PA7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930550L24RikQ99PA7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930550L24RikQ99PA7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930550L24RikQ99PA7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930550L24RikQ99PA7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930550L24RikQ99PA7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
4930550L24RikQ99PA7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
4930550L24RikQ99PA7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930550L24RikQ99PA7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930550L24RikQ99PA7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930550L24RikQ99PA7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930550L24RikQ99PA7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
4930550L24RikQ99PA7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
4930550L24RikQ99PA7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4930550L24RikQ99PA7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930550L24RikQ99PA7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930550L24RikQ99PA7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930550L24RikQ99PA7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930550L24RikQ99PA7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930550L24RikQ99PA7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930550L24RikQ99PA7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930550L24RikQ99PA7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930550L24RikQ99PA7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
4930550L24RikQ99PA7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
4930550L24RikQ99PA7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930550L24RikQ99PA7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930550L24RikQ99PA7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930550L24RikQ99PA7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
4930550L24RikQ99PA7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930550L24RikQ99PA7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930550L24RikQ99PA7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930550L24RikQ99PA7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4930550L24RikQ99PA7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms