Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB3

Tcam1, Cell adhesion molecule TCAM-1, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcam1Q99NB3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcam1Q99NB3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcam1Q99NB3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tcam1Q99NB3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tcam1Q99NB3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcam1Q99NB3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tcam1Q99NB3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tcam1Q99NB3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tcam1Q99NB3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tcam1Q99NB3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tcam1Q99NB3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tcam1Q99NB3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcam1Q99NB3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcam1Q99NB3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcam1Q99NB3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tcam1Q99NB3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tcam1Q99NB3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tcam1Q99NB3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tcam1Q99NB3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tcam1Q99NB3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tcam1Q99NB3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tcam1Q99NB3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tcam1Q99NB3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcam1Q99NB3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcam1Q99NB3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tcam1Q99NB3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tcam1Q99NB3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tcam1Q99NB3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tcam1Q99NB3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tcam1Q99NB3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tcam1Q99NB3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tcam1Q99NB3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tcam1Q99NB3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tcam1Q99NB3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcam1Q99NB3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcam1Q99NB3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcam1Q99NB3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcam1Q99NB3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tcam1Q99NB3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tcam1Q99NB3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tcam1Q99NB3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcam1Q99NB3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcam1Q99NB3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcam1Q99NB3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcam1Q99NB3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcam1Q99NB3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcam1Q99NB3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcam1Q99NB3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcam1Q99NB3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tcam1Q99NB3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcam1Q99NB3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcam1Q99NB3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcam1Q99NB3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcam1Q99NB3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcam1Q99NB3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcam1Q99NB3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcam1Q99NB3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcam1Q99NB3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcam1Q99NB3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcam1Q99NB3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcam1Q99NB3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tcam1Q99NB3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tcam1Q99NB3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tcam1Q99NB3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tcam1Q99NB3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tcam1Q99NB3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcam1Q99NB3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tcam1Q99NB3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcam1Q99NB3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcam1Q99NB3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcam1Q99NB3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcam1Q99NB3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcam1Q99NB3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcam1Q99NB3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcam1Q99NB3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcam1Q99NB3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcam1Q99NB3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcam1Q99NB3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcam1Q99NB3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcam1Q99NB3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcam1Q99NB3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcam1Q99NB3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcam1Q99NB3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcam1Q99NB3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcam1Q99NB3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcam1Q99NB3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcam1Q99NB3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcam1Q99NB3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcam1Q99NB3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcam1Q99NB3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcam1Q99NB3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcam1Q99NB3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcam1Q99NB3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcam1Q99NB3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcam1Q99NB3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcam1Q99NB3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcam1Q99NB3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcam1Q99NB3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcam1Q99NB3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcam1Q99NB3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms