Protein–RNA interactions for Protein: Q99N28

Cadm3, Cell adhesion molecule 3, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cadm3Q99N28 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cadm3Q99N28 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cadm3Q99N28 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cadm3Q99N28 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cadm3Q99N28 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cadm3Q99N28 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cadm3Q99N28 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cadm3Q99N28 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cadm3Q99N28 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cadm3Q99N28 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cadm3Q99N28 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cadm3Q99N28 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cadm3Q99N28 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cadm3Q99N28 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cadm3Q99N28 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cadm3Q99N28 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cadm3Q99N28 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cadm3Q99N28 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cadm3Q99N28 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cadm3Q99N28 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cadm3Q99N28 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cadm3Q99N28 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cadm3Q99N28 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cadm3Q99N28 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cadm3Q99N28 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cadm3Q99N28 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cadm3Q99N28 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cadm3Q99N28 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cadm3Q99N28 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cadm3Q99N28 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cadm3Q99N28 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cadm3Q99N28 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cadm3Q99N28 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cadm3Q99N28 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cadm3Q99N28 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cadm3Q99N28 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cadm3Q99N28 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cadm3Q99N28 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cadm3Q99N28 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cadm3Q99N28 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cadm3Q99N28 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cadm3Q99N28 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cadm3Q99N28 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cadm3Q99N28 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cadm3Q99N28 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cadm3Q99N28 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cadm3Q99N28 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cadm3Q99N28 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cadm3Q99N28 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cadm3Q99N28 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cadm3Q99N28 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cadm3Q99N28 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cadm3Q99N28 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cadm3Q99N28 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cadm3Q99N28 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cadm3Q99N28 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cadm3Q99N28 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cadm3Q99N28 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cadm3Q99N28 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cadm3Q99N28 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cadm3Q99N28 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cadm3Q99N28 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cadm3Q99N28 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cadm3Q99N28 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cadm3Q99N28 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cadm3Q99N28 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cadm3Q99N28 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cadm3Q99N28 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cadm3Q99N28 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cadm3Q99N28 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cadm3Q99N28 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cadm3Q99N28 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cadm3Q99N28 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cadm3Q99N28 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cadm3Q99N28 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cadm3Q99N28 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cadm3Q99N28 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cadm3Q99N28 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cadm3Q99N28 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cadm3Q99N28 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cadm3Q99N28 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cadm3Q99N28 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cadm3Q99N28 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cadm3Q99N28 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cadm3Q99N28 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cadm3Q99N28 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cadm3Q99N28 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cadm3Q99N28 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cadm3Q99N28 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cadm3Q99N28 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cadm3Q99N28 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cadm3Q99N28 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cadm3Q99N28 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cadm3Q99N28 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cadm3Q99N28 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cadm3Q99N28 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cadm3Q99N28 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cadm3Q99N28 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cadm3Q99N28 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cadm3Q99N28 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms