Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PccbQ99MN9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PccbQ99MN9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PccbQ99MN9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PccbQ99MN9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PccbQ99MN9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PccbQ99MN9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PccbQ99MN9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PccbQ99MN9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PccbQ99MN9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PccbQ99MN9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PccbQ99MN9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PccbQ99MN9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PccbQ99MN9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PccbQ99MN9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PccbQ99MN9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PccbQ99MN9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PccbQ99MN9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PccbQ99MN9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PccbQ99MN9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PccbQ99MN9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PccbQ99MN9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PccbQ99MN9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PccbQ99MN9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PccbQ99MN9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PccbQ99MN9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PccbQ99MN9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PccbQ99MN9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PccbQ99MN9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PccbQ99MN9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PccbQ99MN9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PccbQ99MN9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PccbQ99MN9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PccbQ99MN9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PccbQ99MN9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PccbQ99MN9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PccbQ99MN9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PccbQ99MN9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PccbQ99MN9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PccbQ99MN9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PccbQ99MN9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PccbQ99MN9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PccbQ99MN9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PccbQ99MN9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PccbQ99MN9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PccbQ99MN9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PccbQ99MN9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PccbQ99MN9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PccbQ99MN9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PccbQ99MN9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PccbQ99MN9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PccbQ99MN9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PccbQ99MN9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PccbQ99MN9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PccbQ99MN9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PccbQ99MN9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PccbQ99MN9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PccbQ99MN9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PccbQ99MN9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PccbQ99MN9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PccbQ99MN9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PccbQ99MN9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PccbQ99MN9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PccbQ99MN9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PccbQ99MN9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PccbQ99MN9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PccbQ99MN9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PccbQ99MN9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PccbQ99MN9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PccbQ99MN9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PccbQ99MN9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PccbQ99MN9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PccbQ99MN9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PccbQ99MN9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PccbQ99MN9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PccbQ99MN9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PccbQ99MN9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PccbQ99MN9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PccbQ99MN9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PccbQ99MN9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PccbQ99MN9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PccbQ99MN9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PccbQ99MN9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PccbQ99MN9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PccbQ99MN9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PccbQ99MN9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PccbQ99MN9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PccbQ99MN9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PccbQ99MN9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PccbQ99MN9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PccbQ99MN9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PccbQ99MN9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PccbQ99MN9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PccbQ99MN9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PccbQ99MN9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PccbQ99MN9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PccbQ99MN9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PccbQ99MN9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PccbQ99MN9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PccbQ99MN9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms